超级计算机作业,使用Python将多个作业提交给超级计算机

博主正在使用Python自动化向超级计算机提交大量量子力学计算任务,通过创建并执行提交脚本(subOrca_mpi.sh)来实现。脚本涉及到SLURM作业调度系统,包括设置作业名称、输出文件、节点数、运行时间等参数,并使用`sbatch`命令提交作业。社区成员建议使用Python的`subprocess`模块来调用shell脚本。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

我目前正在使用超级计算机进行各种量子力学计算。我需要在任何特定时间提交大量文件(280个单独的子部分)。我正在尝试使用python来自动化这个过程,但是使用python运行一个单独的提交脚本的经验很少。提交脚本我使用(名为subOrca_mpi.sh)是:使用Python将多个作业提交给超级计算机

#!/bin/bash

string=".inp"

root="${1%$string}"

#if [ -z $1 ]

#then

# echo 'Usage: subGamess.sh '

# exit 1

#fi

#if [ ! -f ./$root.inp ]

#then

# echo ' does not look like an Orca input \(*.inp\)'

# exit 1

#fi

if [ -f $root.slurm ]

then

rm $root.slurm

fi

echo '#!/bin/bash'>>$root.slurm

echo '#SBATCH --job-name='$root>>$root.slurm

echo '#SBATCH --output='$root'.out'>>$root.slurm

echo '#SBATCH --nodes=1'>>$root.slurm

echo '#SBATCH --ntasks-per-node=12 '>>$root.slurm

评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值