文献解读|基于转录组-蛋白质组数据联合分析对煎蛋水母毒性评价、毒素筛选及其干预

最新推荐文章于 2025-10-21 00:16:56 发布

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#聚类 #数据挖掘 #机器学习

TITLE：Toxicity evaluation，toxin screening and its intervention of the jellyfish Phacellophora camtschatica based on a combined transcriptome-proteome analysis
译名：基于转录组-蛋白质组数据联合分析对煎蛋水母毒性评价、毒素筛选及其干预
期刊：Ecotoxicology and Environmental Safety
日期：2022年2月
下载链接：
https://doi.org/10.1016/j.ecoenv.2022.113315
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研究介绍

多组学技术的应用为解决海洋有毒水母的物种鉴定、毒素筛选和有效拮抗物构象等三大问题提供了新的研究视角。本研究对煎蛋水母（Phacellophora camtschatica）进行了一系列基于转录组-蛋白质组的分析，并进行了毒性评估。通过形态学观察和细胞色素c氧化酶亚基I（CO1）分子比对，鉴定样品水母为煎蛋水母。研究从成功构建的转录组和蛋白质组中共获得25747个unigenes和3058个蛋白质，其中注释到GO和KEGG数据库的基因分别有6869个（26.68%）和6618个（25.70%）unigenes，以及2536个（82.93%）和2844个（93.00%）蛋白质。水母体内致死作用明显，多器官功能指标和体外活性显著增加。研究者从120种毒素相关unigenes中筛选出62个，包括16种金属蛋白酶，11种磷脂酶等。此外，使用红细胞模型进一步筛选了11种毒素，其中锌金属蛋白酶nas-15样（1）最丰富。最后，地尔硫卓（Diltiazem）大大提高了ICR小鼠的存活率，而EDTA略微延长了ICR小鼠的存活时间。

材料与方法

材料：
在上海的一个人工水族箱搜集水母，然后将