文献解读|WGBS和RNA-seq揭示与吸烟有关的免疫相关疾病的表观遗传机制

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该研究通过WGBS和RNA-seq揭示了吸烟对免疫相关疾病的影响，分析了吸烟者与非吸烟者的DNA甲基化和基因表达差异，探讨了其潜在的表观遗传机制。结果表明，吸烟引起基因组DNA甲基化模式改变，并与基因表达水平相关，为理解吸烟与疾病关联提供了新的视角。

TITLE ：Genome-wide methylation and expression analyses reveal the epigenetic landscape of immune-related diseases for tobacco smoking
译名：WGBS和RNA-seq揭示与吸烟有关的免疫相关疾病的表观遗传机制
期刊：Clinical Epigenetics
日期：2021年12月
下载链接：https：//doi.org/10.1186/s13148-021-01208-0
在这里插入图片描述
研究介绍

吸烟是肺癌、慢性阻塞性肺病（COPD）、心血管疾病（CVD）的主要致病危险因素，是世界上可预防的主要死亡原因。香烟烟雾的成分涉及免疫和炎症过程，这可能会增加香烟烟雾相关疾病的患病率。然而，将吸烟与疾病联系起来的潜在分子机制尚未得到很好的探索。

研究目的

本研究通过分析吸烟者和非吸烟者的WGBS和RNA-seq数据：
（1）描述烟草暴露对中国成年男性吸烟者全基因组DNA甲基化变化的影响；
（2）探讨吸烟相关甲基化与相应RNA表达的关系；
（3）整合DNA甲基化、RNA表达和细胞因子浓度的结果，从多个层面揭示吸烟对吸烟者影响的分子机制，探索吸烟与相关疾病之间的关系。

材料与方法
在这里插入图片描述

为了克服目前DNA甲基化技术在全基因组中仅能捕获有限数量CpG位点的局限性，我们对72名男性进行了全基因组甲基化测序（WGBS）。根据我们的全基因组测序（WGS）数据集，去除罕见变异（MAF < 0.05）。

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