Found conflicts! Looking for incompatible packages. This can take several minutes. Press CTRL-C

hyena_7

已于 2022-09-02 22:21:12 修改

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分类专栏：数据分析文章标签：生物信息 bash

于 2022-09-02 22:19:43 首次发布

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本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/watermel__/article/details/126671235

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在尝试使用conda创建环境并安装R时遇到包冲突，conda提示Found conflicts!。通过尝试conda update --all解决问题，但导致其他包更新并引发代码错误。最终解决方案是在脚本中切换到已有R环境的conda虚拟环境，避免安装冲突。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

今天在HPC上跑一个benchmark的方法，这个方法是利用conda env create -f environment.yml创建虚拟环境，然后我想在这个环境里面安装R环境conda install r,但是报错：Found conflicts! Looking for incompatible packages. This can take several minutes. Press CTRL-C to abort. 我一开始是使用命令：

conda update --all

虽然说可以安装R环境了，但是原本可以跑的代码因为包的更新，而疯狂报错，烦死我了，我急中生智，直接在脚本中更换有R环境的虚拟环境不就好了，不需要安装R环境了，脚本如下：

#!/bin/bash
#SBATCH --gres=gpu:2

for ((i=1;i<=20;i

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