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13/11/2019—— FoxO shutting
FoxO 重要参与的活动是 insulin 介导的。 FoxO是胰岛素敏感的转录因子, 具有一系列下游靶基因和相互作用因子。insulin介导的抑制FoxO是一个穿梭机制, 通过调节FoxO 定位于细胞质内来抑制FoxO的转录功能。影响FoxO穿梭的功能域: 1, 磷酸化位点,phosphorylation sites. 但是FoxO6的穿梭机制和其他FoxO转录因子是不一样的。Fox...原创 2019-11-15 09:26:31 · 3878 阅读 · 0 评论 -
18/10/2019 今日新获得的科研前沿知识--癌细胞和脂肪细胞的关系
来自文献:Adipocytes as Anticancer Drug Delivery Depot 发表于2019/9/25通过改造脂肪细胞来攻击癌细胞。原创 2019-10-18 06:36:31 · 228 阅读 · 0 评论 -
17/10/2019 细胞死亡的十一种方式--转自解螺旋公众号
本文总结于解螺旋公众号《一文参透细胞死亡的11种姿势》。原文有图片,更清晰,感兴趣的可以去搜索学习。细胞死亡的分类: 基于功能方面的差异, 细胞死亡可以分为:意外细胞死亡(ACD) 和调节性细胞死亡(RCD)。前者是不受控制的细胞死亡过程,后者涉及效应分子参与的信号级联反应。RCD类型:1. 细胞凋亡(apoptosis)指机体在生理或病理条件下,为了维持自身内环境稳态,通...转载 2019-10-17 06:18:11 · 6195 阅读 · 0 评论 -
2019/0904_chip-seq在识别组蛋白修饰位点中的作用
#组蛋白:(histone)是真核生物体细胞染色质与原核细胞中的碱性蛋白质,和DNA共同组成核小体结构。它们是染色质的主要蛋白质组分,作为DNA缠绕的线轴,并在基因调控中发挥作用. 所以组蛋白是在所有真核生物的细胞核中,与DNA 结合组成的碱性蛋白质的总称。组蛋白的基因非常保守。亲缘关系较远的种属中,四种组蛋白(H2A、H2B、H3、H4)氨基酸序列都非常相似。存在五个主要的组织蛋白家族:H1/...原创 2019-09-05 19:43:06 · 4934 阅读 · 1 评论 -
20190904_chip-seq/ ATAC-seq/DAP-seq 原理理解
染色质免疫共沉淀Chromatin Immunoprecipitation,ChIP 技术是指:在保持组蛋白和DNA联合的同时,通过运用对应于一个特定组蛋白标记的生物抗体,染色质被切成很小的片断,并沉淀下来。该技术是目前唯一研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。它的基本原理是在活细胞状态下固定蛋白质-DNA复合物,并将其随机切断为一定长度范围内的染色质小片段,然后通过免疫学方法沉淀此复合体,特...原创 2019-09-04 13:15:52 · 10278 阅读 · 0 评论 -
2019/08/16_FoxO_AMP
starvation can increase the antibacterial activity in the hemolymph of B. mori larvae.hemolymph 血淋巴是指:血淋巴(Haemolymphe)是无脊椎动物血腔内流动的血样液体,无色,兼具血液和淋巴样组织液的特性,内含血细胞,间质液和血浆,可占动物体中的30-40%。主要起营养物质运输,温度调节和创伤愈...原创 2019-08-16 12:56:39 · 204 阅读 · 0 评论 -
2019/08/14_用于新基因的生物信息学分析 (转载)
用于新基因的生物信息学分析 核酸序列的基本分析运用DNAMAN软件分析核酸序列的分子质量、碱基组成和碱基分布。同时运用BioEdit(版本7.0.5.3)软件对基因做酶切谱分析。 碱基同源性分析运用NCBI信息库的BLAST程序对基因进行碱基同源性分析(...转载 2019-08-14 08:40:21 · 2772 阅读 · 0 评论 -
2019/07/26_OTUs/phylosymbiotic _名词解释
可执行的分类操作单位,主要是按照16sDNA测序结果计算遗传距离,人为规定遗传距离,然后依此距离区别微生物类群的分类单位,为了形象直观,并有说服力,往往会和已知菌一起做聚类,从而完成微生物的种属归属鉴定。Anoperational taxonomic unit(OTU) is an operational definition used to classify groups of clos...原创 2019-07-26 11:20:10 · 767 阅读 · 0 评论 -
2019/0712_ATAC-Seq
#定义: Assay for Transposase-Accessible Chromatin with highthroughput sequencing(ATAC-Seq)即利用转座酶探究可接近性染色质高通量测序技术。通俗来说就是利用转座酶来获取开放性染色质,再通过高通量测序及生物信息学分析来挖掘相关基因信息,以此探究生物学相关问题。#什么是开放染色质?染色质分为常染色质和异染色质,...原创 2019-07-12 12:49:35 · 453 阅读 · 0 评论