本文记录了在Ubuntu16.04上编译CUDA8.0和OpenCV3.0.0的caffe过程中遇到的问题及解决方案，包括gcc/g++版本、opencv多版本管理、protobuf和glog的版本冲突、cuda与opencv的不兼容以及Parallel Studio的安装问题。通过降级gcc、更新库、修改源码和配置文件等方法成功完成编译。
前言
人生在于折腾!
最近突然想体验一下ubuntu16.04的使用感觉，就重装了操作系统。原本在ubuntu14.04的时候，按照实验室欧大神的博客一路畅通，但此次的caffe编译之旅，可谓到处是坑，遂将这些记录下来。
主要安装路线，依然是按照这篇博客的顺序：http://blog.youkuaiyun.com/shiorioxy/article/details/52652831
安装填坑：
由于我在编译opencv时，想进行多版本的管理，故没有将opencv的安装位置设在/usr/local/中，而是自定义的位置，这需要在以后编译caffe时，在makefile.config中对动态链接库进行配置。
其他主要问题：
1. gcc g++版本问题
ubuntu16.04自带的gcc和g++为5.4.0，但是cuda8.0目前还不支持5以后的版本。如果按照欧博为了兼容matlab2014而降级到gcc4.7的话，编译opencv3.0.0时会出现：
/usr/bin/ld:cannot find -latomic 这是因为gcc4.7还没有正式支持atomic，以后才有新的支持。
我在编译opencv的时候降级到4.9.3.编译opencv没有问题了，但是在编译caffe-master时又会出现l类似下面这样的未定义引用错误：
undefined reference to `google::protobuf::io::CodedOutputStream::WriteStringWithSizeToArray
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