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statTarget-基于QC样本的代谢组学数据校正
为什么数据质量控制重要呢?质量控制是生物分析的基本概念之一,用在保证组学测定的数据的重复性和精确性。由于色谱系统与质谱直接与样品接触, 随着分析样品的增多,色谱柱和质谱会逐步的污染,导致信号的漂移。通过重复使用同一个质控样本来跟踪整个数据采集过程的行为, 已经被大多数的分析化学领域专家推荐和使用。质控样本被用于评估整个质谱数据在采集过程中的信号漂移, 这些漂移进一步能够被精确的算法所识别...原创 2019-03-19 22:40:56 · 4023 阅读 · 1 评论 -
代谢组学数据分析的统计学方法综述
谢组学研究产生大量的数据,这些数据具有高维、小样本、高噪声等复杂特征。如何从复杂的代谢组学数据中提取出有价值的信息,筛选出潜在的生物标志物成为近年来代谢组学研究的热点和难点。据此,本文针对目前代谢组学数据分析中的常用统计学方法及其研究进展进行介绍。代谢组学数据的特点代谢组学是系统生物学领域中继基因组学和蛋白质组学之后新近发展起来的一门学科,它通过检测生物体在受到外源刺激或基因修饰后其...转载 2019-03-16 21:02:36 · 7170 阅读 · 0 评论 -
KEGG数据库
KEGG的简介KEGG是一个整合了基因组、化学和系统功能信息的数据库。把从已经完整测序的基因组中得到的基因目录与更高级别的细胞、物种和生态系统水平的系统功能关联起来是KEGG数据库的特色之一。与其他数据库相比,KEGG的一个显著特点就是具有强大的图形功能,它利用图形而不是繁缛的文字来介绍众多的代谢途径以及各途径之间的关系,这样可以使研究者能够对其关注的代谢途径有直观全面的了解。KEGG ...原创 2019-03-24 22:35:18 · 5120 阅读 · 0 评论 -
SMILES | 简化分子线性输入规范
简化分子线性输入规范(SMILES,Simplified molecular-input line-entry system)是一种用ASCII字符串明确描述分子结构的规范,由David Weininger和Arthur Weininger于20世纪80年代晚期开发,并由其他人,尤其是日光化学信息系统有限公司修改和扩展。 SMILES字符串可以被大多数分子编辑软件...原创 2019-10-02 15:46:28 · 9356 阅读 · 0 评论