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目录1. 环境2. 驱动安装2.1 驱动下载：https://www.nvidia.com/download/driverResults.aspx/132541/2.2.删除原有NVIDIA驱动2.3禁用nouveau2.4.查询自己的显卡型号2.5.安装2.6.检验是否安装成功，命令3. CUDA9.1安装3.1 CUDA9.1下载：3.2 在cuda...

AMBER分子动力学程序包是由加州圣弗兰西斯科大学(University of California San Francisco,UCSF)的Peter A Kollman和其同事编写的，程序很全，大约包含60多个程序，相互协调工作。现在已经发展到版本17。AMBER功能涵盖种类非常多的生物分子，包括蛋白、核算以及药物小分子。硬件环境：硬件环境：编译依赖yum ins...

ACPYPE，基于Python的工具，使用Antechamber生成化学化合物的拓扑，并提供python与其他应用程序的接口。将AMBER力场文件转换为GROMACS的拓扑文件。acpype安装包下载svn checkout http://ccpn.svn.sourceforge.net/svnroot/ccpn/branches/stable/ccpn/python/acpy...

硬件环境：1. 解压安装包tar jxvf AmberTools18.tar.bz2tar jxvf Amber18.tar.bz22. 安装环境依赖需要使用默认的CentOS7编译器，以及gcc4.8.5编译的CUDA组件。su rootyum install gcc gcc-gfortran gcc-c++ flex tcsh zlib-devel \...

力场力场(Force Field, 常简写为FF)这个物理学名词听起来有点高深, 可如果理解了它的含义你就会觉得这是很自然的一个概念, 没有什么特别之处.在中学物理或者初等力学中, 研究物体的运动都是从分析其受力出发的, 可以说是以力为基础, 这也是称为力学的原因. 牛顿第二定律直接将物体的受力与其加速度联系起来, 这样只要知道了物体的受力情况, 就能计算出其运动轨迹. 在力学中, 一般将...