R 画箱线图

次第花开缓缓归来

于 2018-01-03 15:47:44 发布

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分类专栏：生物信息

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本文通过使用R语言的ggplot2包对CDR15.csv文件中的数据进行处理，并采用小提琴图的方式展示了当CDR1长度为5时，CDR2及CDR3长度的分布情况。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

data<-read.csv("cdr15.csv",header=T)
library(ggplot2)
library(reshape2)
data_m=melt(data)
# variable和value为矩阵melt后的两列的名字，内部变量, variable代表了点线的属性，value代表对应的值。
#箱线图
#p1<-ggplot(data_m,aes(x=variable,y=value),color=variable)+
#  geom_boxplot(aes(fill=variable))
#violin plot
p2<-ggplot(data_m,aes(x=variable,y=value),color=variable)+
  geom_violin(aes(fill=variable))+
  theme(axis.text.x = element_text(size = rel(1.2)))+   #调整横轴文本的大小，角度angle=90  
  labs(x="",y="length",title="The distribution of CDR2,3 length when CDR1 length is 5")  #添加横纵轴名称

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