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RSS订阅原创 Linux系统硬盘挂载和磁盘分区
注：ext2 (second extended filesystem), ext3 (Third extended filesystem), ext4, ext系列有向下兼容特性。服务器存储是由一系列的磁盘组成的盘阵，在做完raid创建Virtual Disk，通常需要对硬盘分区和格式，linux下常用的分区工具主要有。常用的文件系统包括1，ext2文件系统；3，ext4文件系统；fdisk -l # // 列出系统磁盘，一般数据盘标识第一块/dev/sda, /dev/sdb。
2024-12-02 15:08:59
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原创 phentmap颜色范围调整
pheatmap 热图展现时间 值域和颜色范围设置不恰当，同样的数据热图对比度不明显，调整到合适的对应关系，可以增加对比度，方便 看出数字的规律，如下图pheatmao包可以设置breaks进行调整，
2024-08-07 16:07:24
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原创 office（word）标题正文格式快速编辑和页眉分章设置
在使用word文档时，如撰写毕业论文，公司文档时经常会调整格式，比如章标题，节标题，图表标题格式设置。此外，页眉有时需要分章节不同显示，针对以上问题，总结小技巧如下。
2024-01-10 17:38:18
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原创 Nexflow 工作流程系统控制甲基化分析MeRIPseqPipe的相关配置问题
运行脚本时直接设置。安装对应版本，需要首先执行，nextflow版本使用NXF_VER设置，如。
2023-10-12 19:22:56
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原创 linux环境下X11相关问题解决和环境配置 （unable to start device X11cairo）
linux下使用R或者python等命令行操作时，绘图的弹出一般会借助X11 （X11显示FALSE，针对以上问题，具体解决方法如下。
2023-09-07 16:31:50
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原创 Python 图形化模块matplotlib,Seaborn, plotnine笔记
数据可视化方面，python有matplotlib, Seaborn和plotnine等静态图表绘制包，Seaborn和plotnine都是有matplotlib发展而来，Seaborn只能作为补充，不能替代，plotnine类似于ggplot的语法。
2023-09-02 12:07:30
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原创 Python集成开发环境和数据结构
详细介绍了python数据结构，并针对性的介绍了NumPy和Pandas包的相关表格转换，分组统计，类似于R的数据框统计，同时对缺失值和数据表格的保存和提取做了简单介绍
2023-09-01 22:01:20
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1原创 Network File System (NFS) 应用于服务器共享存储和相关配置
NFS 多台服务器共享存储配置，相关配置文件说明，服务状态查看和启用，服务器相关系统工具安装和配置。
2023-04-22 16:34:07
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原创 upset plot
1. upset 概述upset展现多个数据集合的交互关系的图形，类似于传统的venn图数据输入格式：list(set1=c(), set2=c())，通过字符UpSetR会自动算出交集；另外可以写成0和1的矩阵，0代表不存在，1，代表存在，在矩阵中看不同子集的共有元素情况。此外，list可以通过list_to_matrix函数转化为矩阵形式。2. Upset modemode有三种模式，distinct：常用的，理解为venn形式的；intersect：共有的，不考虑在余下数据集中是否有；uni
2021-09-05 18:33:41
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原创 ComplexHeatmap学习笔记和总结
ComplexHeatmap学习笔记和总结声明：本文档是在学习ComplexHeatmap和测试例子过程中，相关方法的小结，方便回顾查看，快速实现数据可视化，理解错误之处，欢迎批评指正1. ComplexHeatmap总览ComplexHeatmap软件包主要用来展现热图，常说的热图包括，body和components(title， dendrograms, matrix names 和热图注释（放在热图旁，该可根据注释组合不同的复杂图形）。heatmap body部分可以根据行和列分割。整体
2021-09-05 17:54:57
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原创 阿里云系统下安装 R，java，python
阿里云系统下安装 R，java，python以下仅限有root权限的用户，普通用户，一般是./configure --prefix="/user/lcoal/dir" && make && make install 基本可以安装，少量依赖程序自己安装即可。安装R最近申请了阿里云服务器，需要用到R, 好多依赖程序没有，参照网上的教程进行了安装，中间遇到一些问题做如下记录，用的是red hat系统，主要在安装openssl和curl中遇到问题，ope...
2021-08-16 10:06:15
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原创 R环境配置和R包安装
1. ## 环境变量脚本语言在linux环境下都有对应环境变量，python--PYTHONPATH，perl--PERL5LIBS,R--R_LIBS脚本语言的环境变量，类似linux的***PATH， LD_LIBRARY_PATH，***存在多重继承的关系，不同路径以： 分割，优先级依次下降，执行程序默认在解释程序安装路径下查找包和配置文件。R 解释器在执行脚本时，默认在安装路径下library查找安装包，如果想改变安装包搜索路径，可以手动设置：export R_LIBS="/use
2021-08-16 10:05:42
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空空如也
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