u010270891的博客

一、2016二、2013

问题：R语言进行计算，40M的数据，串行情况下内存消耗大约1G作用，耗时半小时，使用并行，打开2个线程，内存瞬间飙升到30G，且耗时超级久。原因：首先，不是程序本身的问题。R语言主要用于计算，本身并行机制并不完善，所以不适合做并行。R语言并行机制：这篇博客介绍的很详细https://blog.youkuaiyun.com/a358463121/article/details/51695054...

一、相关概念1、差异表达基因，是两个group之间有统计学差异的gene，以芯片为例的话，几万个探针里可能差异的就1000个左右（当然根据设定阈值差异很大）2、hub基因，和网络中的hub节点一样，是degree高的gene，在基因表达网络中有高的连接度degree，不涉及betweeness等。并且hub基因的筛选有很大的人为因素，到底是取前5%还是10%没有具体要求，一般建议5%。也就...