<?xml version="1.0" encoding="utf-8" ?><rss version="2.0"><channel><title><![CDATA[twocanis的博客]]></title><description><![CDATA[]]></description><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis</link><language>zh-cn</language><generator>https://blog.youkuaiyun.com/</generator><copyright><![CDATA[Copyright &copy; twocanis]]></copyright><item><title><![CDATA[多部位样本联合代谢组学共有与特有代谢产物组合热图]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/135351002</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/135351002</guid><author>twocanis</author><pubDate>Tue, 02 Jan 2024 22:18:13 +0800</pubDate><description><![CDATA[拿到了瘤胃液、血液、牛奶的代谢组学结果，想找出这几种体液之间差异代谢物的关联，偶然在师妹那里看到了下面这个图，描述的是两组间差异脂质类代谢物在三种体液内的分布与代谢组鉴定强度，用这样一种组合热图的方式展现，包含了每种体液包含差异代谢物的种类、差异代谢物在组间的鉴定强度、差异代谢物的分类，以及能看出共有、特有以及流向分布等信息，不只是代谢组学，同理可运用到其他多组织部位的联合组学。下面用我自己的数据描述复刻过程。more。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[基于R和gephi做宏基因组与代谢组等多组学联合network相关性网络图]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/133783419</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/133783419</guid><author>twocanis</author><pubDate>Thu, 12 Oct 2023 09:34:48 +0800</pubDate><description><![CDATA[拿到多组学的数据后一直在找合适的方法将二者进行关联，比如我这里是三种体液的代谢组与一种体液的宏基因组。需求是对多组学进行关联分析，直到最近看到不少文章里利用Gephi将相关性表格进行可视化的图，效果还不错，于是写个过程记录自用。这里演示的是属水平的差异菌群相对丰度（宏基因组结果）与代谢组鉴定到的差异代谢物进行关联。先是计算相关性生成graphml格式文件使用Gephi软件进行可视化。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[基于R的linkET包qcorrplot可视化Mantel test相关性网络热图分析correlation heatmap]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/133313555</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/133313555</guid><author>twocanis</author><pubDate>Tue, 26 Sep 2023 16:09:25 +0800</pubDate><description><![CDATA[需求是对瘤胃宏基因组结果鉴定到的差异菌株与表观指标、瘤胃代谢组、血清代谢组、牛奶代谢组中有差异的部分进行关联分析，效果图如下：逗号分隔的csv格式文件，两个表格，一个是每个样本对应的表观指标数据，另一个是每个样本对应的菌群丰度，我这里用的是genus水平
如果报错R版本有问题装不上（我的4.3.1版本R出现了这个报错）请尝试：]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[宏基因组做在线组间差异Anosim分析与结果解读]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/133231782</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/133231782</guid><author>twocanis</author><pubDate>Sun, 24 Sep 2023 09:19:40 +0800</pubDate><description><![CDATA[需求是返回的结果每组样本数量比较多，但组间差异不明显，挑出来重分析。详情请参考 [组间差异分析：Anosim]([)， 当然亲测更简便的方法可以借助。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[基于R做宏基因组进化树+丰度柱状图TreeBar带聚类树的堆叠柱形图]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/133231729</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/133231729</guid><author>twocanis</author><pubDate>Sun, 24 Sep 2023 09:16:46 +0800</pubDate><description><![CDATA[画TreeBar，重分析需要所以自己找了各路代码借鉴学习，详情请参考。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[关于双持苹果安卓手机设备的验证码短信转发tips]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/132224297</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/132224297</guid><author>twocanis</author><pubDate>Fri, 11 Aug 2023 09:36:11 +0800</pubDate><description><![CDATA[需要用安卓机接收短信，然后安卓机不在身边的时候也可以及时转发到苹果机上。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[基于R做宏基因组的进化树ClusterTree分析]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/132223867</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/132223867</guid><author>twocanis</author><pubDate>Fri, 11 Aug 2023 09:15:20 +0800</pubDate><description><![CDATA[同上一篇的PCoA分析，这个也是基于公司结果基础上的再次分析，重新挑选样本，在公司结果提供的csv结果表上进行删减，本地重新分析作图。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[基于R做宏基因组结果的PCoA分析]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/132223650</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/132223650</guid><author>twocanis</author><pubDate>Fri, 11 Aug 2023 09:12:17 +0800</pubDate><description><![CDATA[选取不同样本属水平的丰度数据，利用r的vegan包等绘制PCoA图]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[代谢组学结果在线分析：不同组差异代谢物高级韦恩图Venn的绘制——UpSet图]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/129780784</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/129780784</guid><author>twocanis</author><pubDate>Sun, 26 Mar 2023 16:28:23 +0800</pubDate><description><![CDATA[分析代谢组数据，网站在线制作不同组差异代谢物的高级Venn图之UpSet图，用于比较数据集直之间的交集关系]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[视频剪辑语音转文字添加字幕]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/129651264</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/129651264</guid><author>twocanis</author><pubDate>Sun, 19 Mar 2023 15:22:35 +0800</pubDate><description><![CDATA[视频中的语音直接转文字形成srt字幕文件，一键导入即可添加字幕]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[摸鱼技能学习-持续更新]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/125752600</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/125752600</guid><author>twocanis</author><pubDate>Tue, 12 Jul 2022 21:33:47 +0800</pubDate><description><![CDATA[记录工作学习中摸到的有意思的鱼并分享一些能提高生产力的小技巧，记录自用]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[PC端微信更新至3.7.0版文件保存至MsgAttach文件夹乱码问题解决]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/125272362</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/125272362</guid><author>twocanis</author><pubDate>Tue, 14 Jun 2022 09:48:45 +0800</pubDate><description><![CDATA[因为微信升级到3.7.0，发现了一个微信文件接收到本地储存地址到MsgAttach文件夹乱码的bug，这里找到方法实测解决]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[SPSS单因素方差分析教程]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/125192298</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/125192298</guid><author>twocanis</author><pubDate>Wed, 08 Jun 2022 20:59:31 +0800</pubDate><description><![CDATA[SPSS单因素方差分析，非正态分布的秩和检验]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[U盘/移动硬盘拔出提示被占用情况的处理办法]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/124475614</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/124475614</guid><author>twocanis</author><pubDate>Thu, 28 Apr 2022 15:43:27 +0800</pubDate><description><![CDATA[U盘/硬盘弹出时显示“该设备正在使用中”解决办法]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[绘制包含Fold Change的差异代谢产物HMDB（KEGG）分类图]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/123831921</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/123831921</guid><author>twocanis</author><pubDate>Tue, 29 Mar 2022 21:03:56 +0800</pubDate><description><![CDATA[针对代谢组学结果，根据KEGG或者HMDB分类绘制包含Fold Change变化的差异代谢产物分类图，使用到的软件包括excel、graphpad、AI等。]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[BODIPY脂滴染色流式荧光检测-Beckman流式仪-Summit流式数据分析软件]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/123827403</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/123827403</guid><author>twocanis</author><pubDate>Tue, 29 Mar 2022 17:47:36 +0800</pubDate><description><![CDATA[探究在添加物刺激下BMEC细胞脂滴分泌的变化情况，使用BODIPY染料进行脂滴染色，Beckman公司流式仪器检测，配套summit软件处理]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[Echarts绘制差异代谢产物分类与KEGG通路分类的旭日图]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/122339599</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/122339599</guid><author>twocanis</author><pubDate>Thu, 06 Jan 2022 11:20:21 +0800</pubDate><description><![CDATA[将实验样本的代谢组进行数据可视化，利用Echarts绘制差异代谢产物分类与HMDB化学分类的旭日图]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[搭建hexo博客修改设置网页图标icon失败的解决方法]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/122339480</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/122339480</guid><author>twocanis</author><pubDate>Thu, 06 Jan 2022 11:13:45 +0800</pubDate><description><![CDATA[问题描述
基于hexo新搭建好的个人博客想更换网页图标的icon
期望达到的效果
更换前：

更换后：

背景
我用的chrome浏览器，使用的是yilia主题，参考 前端 | hexo+yilia博客主题设置网页ico小图标 设置后一直不成功
尝试的的解决途径

直接去根目录下的/blog/_config.yml添加修改favicon，失败
更改icon图片存放位置，并在主题/themes/yilia/_config.yml文件中修改对应路径，失败
去/blog/public/index.hmtl下F12]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[基于R的ggplot2包画KEGG富集通路气泡图_KEGGdot]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/121845958</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/121845958</guid><author>twocanis</author><pubDate>Thu, 09 Dec 2021 22:48:05 +0800</pubDate><description><![CDATA[背景**
基于公司已给出的结果上做出调整（公司只给出了top10），画KEGG富集通路的气泡图，初始文件如下图


代码演示
&gt; getwd() #显示工作目录
&gt; setwd() #如果上述显示不是想要的路径，可以新建一个文件夹然后设置成工作目录，方便一些原始文件以及结果图片的存放
&gt; install.packages("ggplot2",destdir="D:/RData/R-win-4.0.2/R-4.0.2/R-packages",lib="D:/RData/R-win-4.0.2]]></description><category></category></item><item><title><![CDATA[代谢组学分析常用网站]]></title><link>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/121845176</link><guid>https://blog.youkuaiyun.com/twocanis/article/details/121845176</guid><author>twocanis</author><pubDate>Thu, 09 Dec 2021 22:00:07 +0800</pubDate><description><![CDATA[MetaboAnalyst 5.0
MetaboAnalyst 5.0
可进行代谢组数据的可视化分析，Module Overview如下，包括Biomarker Analysis/ Enrichment Analysis/Pathway Analysis/Joint Pathway Analysis/Network Analysis以及各种封图分析等，基本送测公司的报告里头的结果图，只要拿到excel检测结果信息表都能在这个网站自己做，操作简单直接上手

Interactive Pathways Expl.]]></description><category></category></item></channel></rss>