
实验
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twocanis
这个作者很懒,什么都没留下…
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绘制包含Fold Change的差异代谢产物HMDB(KEGG)分类图
针对代谢组学结果,根据KEGG或者HMDB分类绘制包含Fold Change变化的差异代谢产物分类图,使用到的软件包括excel、graphpad、AI等。原创 2022-03-29 21:03:56 · 6414 阅读 · 2 评论 -
BODIPY脂滴染色流式荧光检测-Beckman流式仪-Summit流式数据分析软件
探究在添加物刺激下BMEC细胞脂滴分泌的变化情况,使用BODIPY染料进行脂滴染色,Beckman公司流式仪器检测,配套summit软件处理原创 2022-03-29 17:47:36 · 8485 阅读 · 4 评论 -
Echarts绘制差异代谢产物分类与KEGG通路分类的旭日图
将实验样本的代谢组进行数据可视化,利用Echarts绘制差异代谢产物分类与HMDB化学分类的旭日图原创 2022-01-06 11:20:21 · 3135 阅读 · 0 评论 -
代谢组学分析常用网站
MetaboAnalyst 5.0MetaboAnalyst 5.0可进行代谢组数据的可视化分析,Module Overview如下,包括Biomarker Analysis/ Enrichment Analysis/Pathway Analysis/Joint Pathway Analysis/Network Analysis以及各种封图分析等,基本送测公司的报告里头的结果图,只要拿到excel检测结果信息表都能在这个网站自己做,操作简单直接上手Interactive Pathways Expl.原创 2021-12-09 22:00:07 · 4010 阅读 · 0 评论 -
使用image Pro plus 6.0分析细胞油红O染色结果计数/计算面积百分比
前言自己做实验需要给细胞脂滴染色,在网上找资料摸索找到的一些内容,能够快速方便的计算油红O染色后的脂滴数量以及占面积百分比,简单总结一下,如果有问题或者建议欢迎一起交流学习~油红O染色简单步骤我自己这次使用的六孔板,第一次做乳腺上皮细胞,直接用的师兄给的油红O染液(结果工作液状态太久可能失效了,也可能是细胞本身原因脂滴分泌不明显),实验失败了,但还是练手了后面分析过程记录下来染色步骤:参考细胞油红o染色用枪头吸出培养液,加入2mL PBS轻轻晃动漂洗,吸出PBS弃掉每孔加入2mL 95%酒精(原创 2021-03-10 19:27:02 · 35871 阅读 · 19 评论