twocanis的博客

#读取压缩文件$ zcat R1.fq.gz会唰唰唰全部读取，按Ctrl + C终止#只查看部分$ less R1.fq.gz按↓键可往下翻页，按q退出

Linux下fastp的使用这里使用conda安装的fastp（用于序列质控），第一次学习操作，记录一下到miniconda的安装目录下的bin下启动conda环境$ cd /home/twocanis/yes/bin#我安装的时候一路yes结果把安装目录也写成了yes……启动conda$ . ./activate成功后会出现（base）字符创建一个存放需要处理的文件的输入和输出的工作目录创建工作目录$ mkdir -p bioitem将需要处理的文件复制到该工作目

Linux中安装minicondaminiconda即conda的简略版，常用于Linux中的生信分析Linux中conda的安装wget -c https://repo.continuum.io/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh安装过程一路yes，但中间有个给文件夹命名的步骤记得命名文件夹换成清华镜像源，速度更快conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu

文章目录前言命令格式目录处理命令前言​ 自学Linux，根据B站Linux视频教程—兄弟连整理的部分笔记命令格式命令格式：命令 [-选项] [参数]例：ls -la/etc说明：1）个别命令使用不遵循此格式2）当有多个选项时，可以写在一起3）简化选项与完整选项-a等于–all目录处理命令：ls命令名称：ls命令英文原意：list命令所在路径：/bin/ls执行权限：所有用户功能描述：显示目录文件语法：ls选项[-ald] [文件或目录]-a显示所有文件，包括隐藏文件-