5、非编码RNA及其数据库

非编码RNA及其数据库

1. 非编码RNA的介绍

非编码RNA(ncRNA)是基因组转录产物中的一大类,它们不编码蛋白质,但却在细胞内发挥着多种关键功能。近年来,随着研究的深入,ncRNA的重要性逐渐被认识到,特别是在基因调控、染色质修饰、RNA剪接、RNA干扰等方面。非编码RNA可以分为多种类型,如rRNA、tRNA、miRNA、siRNA、piRNA等,每种类型在细胞中都有独特的功能。

非编码RNA的功能

  1. 基因表达调控 :miRNA和siRNA等小RNA分子可以通过与靶mRNA结合,抑制其翻译或促进其降解,从而调控基因表达。
  2. 染色质结构修饰 :lncRNA可以与染色质修饰复合物相互作用,改变染色质状态,影响基因转录。
  3. RNA剪接 :snRNA参与剪接体的组装,确保mRNA前体正确剪接。
  4. RNA干扰 :siRNA和piRNA通过RNA干扰途径沉默特定基因的表达。

2. 相关数据库

随着非编码RNA研究的进展,越来越多的数据库被创建,用于存储和管理这些分子的信息。以下是几个常用的非编码RNA数据库:

Rfam数据库

Rfam数据库是由欧洲生物信息学研究所(EBI)和桑格研究所共同维护的一个综合性的非编码RNA数据库。它包含了多种类型的非编码RNA家族,并提供了详细的注释信息。Rfam数据库的特点如下:

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