特定功能微生物多样性分析

于 2022-04-26 17:30:23 发布
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本文探讨了功能微生物，特别是氨氧化细菌、硫细菌和硝化细菌，以及如何基于功能基因和持家基因进行高通量测序分析。微基生物提供个性化建库和分析服务，使用Illumina平台进行微生物生态研究。案例分析展示了在模拟家畜废水处理中，反硝化细菌群落演替和环境变量的影响，提出通过关联网络图选择优势菌株以优化生物反应器性能。

摘要生成于 C知道 ，由 DeepSeek-R1 满血版支持， 前往体验 >

——基于功能基因/持家基因/靶基因

在自然界的各类环境中，都有微生物的存在，它们在各自的“岗位”上都发挥着或大或小、或多或少的作用。有一些具有特殊功能的微生物，由于其作用的重要性或特殊性而受到人们的广泛关注，这些具有特殊功能的微生物叫做功能微生物，如氨氧化细菌、硫细菌、硝化细菌等。它们在分类学上有可能差异很大，但却具有相同或类似的基因使其能够发挥同样的作用。支配这些功能细菌发挥重要功能的基因被称为功能基因，如amoA、dsrB、nxrA。目前微基生物已收集GeneBank中所有已知功能基因的序列及其对应的种属信息，构建自己的功能基因数据库。 

 微基生物可根据客户需求，针对功能基因或持家基因，设计PCR通用引物，开展个性化建库及分析。 此类方法，可针对属内各种，甚至亚种，进行细致地分类及分析，并与环境数据相结合，可用于某类微生物精细的分类及进化研究。部分已完成功能基因建库分析及引物列表（其他功能基因请垂询）。

功能微生物

测序基因

特异引物

推荐平台

产甲烷菌

16S rRNA gene

Arch519F / Arch915R

MiSeq 2×300

硫酸盐还原菌SRB

dsrB

dsrF / dsrR

MiSeq 2×300

硝化细菌AOB
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