11、遗传分析：连锁与关联研究

遗传分析：连锁与关联研究

1. 连锁分析简介

连锁分析是遗传学研究中的重要方法，用于确定基因之间的相对位置和遗传距离。在连锁分析中，我们常常关注父母与子女之间的单倍型传递情况。不同的父母双倍型会导致不同的单倍型传递概率，具体如下表所示：
| 父母双倍型 | 传递的单倍型 ab | 传递的单倍型 aB | 传递的单倍型 Ab | 传递的单倍型 AB |
| — | — | — | — | — |
| ab|ab | 1 | 0 | 0 | 0 |
| ab|aB | 1/2 | 1/2 | 0 | 0 |
| aB|aB | 0 | 1 | 0 | 0 |
| ab|Ab | 1/2 | 0 | 1/2 | 0 |
| ab|AB | (1 - θ)/2 | θ/2 | θ/2 | (1 - θ)/2 |
| aB|Ab | θ/2 | (1 - θ)/2 | (1 - θ)/2 | θ/2 |
| aB|AB | 0 | 1/2 | 0 | 1/2 |
| Ab|Ab | 0 | 0 | 1 | 0 |
| Ab|AB | 0 | 0 | 1/2 | 1/2 |
| AB|AB | 0 | 0 | 0 | 1 |

2. 直接计数法

直接计数法是一种简单的连锁分析方法，它主要包括以下三个步骤：
1. 识别亲子对 ：找出双亲为双杂合子的亲子对。如果一个孩子有两个双杂合子的父母，由于孟德尔第一定律，父母的传递是独立的，所以该孩子会被包含在两个亲子对中。这里的有效样本量是传递次数，而非后代数量。
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