14、点选式图工具的使用指南

点选式图工具的使用指南

在图数据的分析与可视化领域，有几款强大的工具值得我们深入了解，它们分别是 Gephi、Cytoscape 和 yEd。下面将详细介绍这些工具的特点、使用方法及注意事项。

1. Gephi

Gephi 是一款功能强大但有些小脾气的图分析与可视化工具。它能生成美观的图形，在与布局交互时能提供不错的体验，但在其他任务中可能会让人感到沮丧。

1.1 模式差异

Gephi 有概述模式和预览模式，这两种模式的功能和默认设置有所不同，特别是在视觉属性方面：
| 视觉属性 | 概述模式 | 预览模式 |
| ---- | ---- | ---- |
| 大小 | 边宽、节点标签和节点大小可能与预览不同，可能需要缩放 | - |
| 颜色 | 边颜色比预览模式深，节点有深色轮廓 | - |
| 曲线链接 | 不可用 | 可用 |
| 标签 | 只有特定大小以上的标签会显示 | 所有标签都显示 |

如果需要高质量的输出，建议使用预览模式并导出为 PDF 或 SVG 文件。可以在概述模式和预览模式之间切换查看效果，而不是先在概述模式中追求完美。

1.2 数据处理

Gephi 支持多种数据导入和导出格式，可用于将图数据从一种文件格式转换为另一种。不过，它并非支持每种文件格式的所有功能。在数据导入时，它会提供有用的反馈，有助于数据准备。
- GDF 文件 ：Gephi 与 GDF 文件配合良好，GDF 文件可以使用 Excel 等工具轻松生成，但必须遵循 Gephi 假定的列命名约定。可参