R和Python交互使用中出现/usr/lib64/libstdc++.so.6: version `CXXABI

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本文详细记录了在使用Python和R进行数据交互时遇到的libstdc++.so.6版本不匹配问题。通过升级操作、查找错误来源及更新动态库链接，最终解决了因版本`CXXABI_1.3.9`未找到导致的错误，确保了程序的正常运行。

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/usr/lib/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.9’ not found

1.升级操作

在R和python实现交互的时候，配置hive的数据读取后，进行了升级操作

yum -y install gcc gcc-c++ cyrus-sasl-devel cyrus-sasl-plain

2.查看错误

运行部分的python程序脚本时，出现了错误

Error in py_run_file_impl(file, local, convert) : 
  ImportError: /usr/lib64/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.9' not found (required by /opt/anaconda3/lib/python3.5/site-packages/google/protobuf/pyext/_message.cpython-35m-x86_64-linux-gnu.so)

3.解决问题

于是我查找/libstdc++.so.6: version `CXXABI_1.3.9文件，并进入路径进行查找

[root@nhost21 jhapp]# find / -name "libstdc++.so.*"
/opt/anaconda3/envs/python36/lib/libstdc++.so.6.0.25
/opt/anaconda3/envs/python36/x86_64-conda_cos6-linux-gnu/sysroot/lib/libstdc++.so.6
/opt/anaconda3/envs/python36/x86_64-conda_cos6-linux-gnu/sysroot/lib/libstdc++.so.6.0.25

发现系统中的版本好还有大于libstdc++.so.6的，因此，需要对该路径下的包进行配置

（1）复制高版本的libstdc

cp/opt/anaconda3/envs/python36/x86_64-conda_cos6-linux-gnu/sysroot/lib/libstdc++.so.6.0.25   /usr/lib64/

(2)进入lib64路径建立软连接

cd /usr/lib64
rm -rf libstdc++.so.6
ln -s libstdc++.so.6.0.25 libstdc++.so.6

(3)查看原先的链接

strings /usr/lib/libstdc++.so.6 | grep 'CXXABI'
[root@nhost21 lib]# strings /usr/lib64/libstdc++.so.6 | grep 'CXXABI'
CXXABI_1.3
CXXABI_1.3.1
CXXABI_1.3.2
CXXABI_1.3.3
CXXABI_1.3.4
CXXABI_1.3.5
CXXABI_1.3.6
CXXABI_1.3.7
CXXABI_1.3.8
CXXABI_1.3.9
CXXABI_1.3.10
CXXABI_1.3.11
CXXABI_TM_1

确定更新的连接是否到新的动态库中，存在则说明成功。