CNV分析流程学习
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用来记录基于SNP芯片的CNV数据挖掘
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CNV预实验1-使用GenomeStudio进行芯片原始数据的处理
再点进去之后就是每个芯片的分型数据，芯片的分型数据包含两个文件，即以Grn.idat和Red.idat结尾的原始分型文件， 即红光和绿光所在位置的测序文件。这个区域展示了SNP的信息，包括每个位点的染色体号，物理位置以及关键的每个个体在该位点识别的基因型。接着选择要分析的芯片的原始数据文件，注意这里只需要选择之前提到的以iDats结尾的文件夹即可。红框选择芯片对应的支持文件，这个文件可以在illumina公司直接下载对应的。但也有比较差的情况，这种分出来的基因型是不准确的，后续分析中一般会剔除。原创 2023-09-25 12:54:10 · 979 阅读 · 2 评论 -
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