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原创 MCScan(JCVI)——物种间共线性分析及可视化

油菜(Brassica napus)、白菜(Brassicarapa)、甘蓝(Brassica oleracea)以及拟南芥(Arabidopsis thaliana)的cds文件,蛋白pep文件和gff3文件,数据均来源于Ensembl网站(https://plants.ensembl.org/index.html)

2025-01-22 17:14:24 2170

原创 VMware虚拟机安装及配置【自用】

自用

2025-01-22 12:00:18 214

原创 使用TBtools进行物种间共线性分析

Sequence Toolkit ---Fasta Tools ----ID Prefix (fasta文件)

2024-12-11 23:38:16 2533 4

原创 AutoDock将导入pdb文件时报错swig/python detected a memory leak of type ‘BHtree *‘, no destructor found

autodock报错swig/python detected a memory leak of type 'BHtree *', no destructor found

2024-11-09 15:26:33 1413 6

原创 R4.4.1安装程序包 argparse、minpack.lm

GenomeScope 2.0的工作依赖于R,且需要安装其依赖包:argparse、minpack.lm。可以使用R进行安装

2024-10-28 16:56:20 316

原创 Ubuntu20.04安装共线性分析软件MCScanX

MCScanX需要在jdk和libpng的环境下运行,而libpng又需要zlib

2024-08-03 22:13:41 908 2

原创 pip安装selenium报错Could not find a version that satisfies the requirement selenium(from versions: none)

升级pip,安装selenium、lxml

2024-08-02 20:56:34 377

原创 同源基因MEGA建树

最大似然法建树,调参

2024-04-22 16:08:33 1807

原创 Ubuntu运行orthofinder结果错误

反反复复试了很多遍,但不管是增添物种数还是卸载重安装还是换设备运行,一直报错,结果文件一直不对,崩溃了。

2024-03-16 15:39:45 543 1

原创 Biopython

利用Biopython包读取文件NC_045512.2.gb(GenBank格式),内容为新冠病毒序列(id:NC_045512.2),将其中FEATURE的类型为CDS的序列片段及其信息截取出来,包装为SeqRecord对象,再存储为fasta格式的文件:NC_045512.2_CDS.fasta

2024-03-13 03:00:00 969

原创 Ubuntu20.04安装Rstudio、Rstudio Server报错Dependency is not satisfiable:libssl1.0.0|libssl1.0.2|libssl1.1

在安装Rstudio及Rstudio Server前要先装R官网都有操作步骤,一步步来就可以了,网上也都可以搜到,这里就不详细写了。输入用户名密码(Ubuntu服务器用户名密码)在浏览器输入http://你的ip:7878。

2024-03-05 23:08:17 833

原创 Ubuntu20.04安装orthofinder

orthofinder安装

2024-03-03 21:21:23 1120

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