几何泛函数据分析的生物医学应用
1. 引言
几何泛函数据分析在生物医学领域有着广泛的应用。本文将介绍其在脑肿瘤、脑白质纤维束、子宫内膜组织和注意力缺陷多动障碍(ADHD)分类等方面的应用,探讨如何通过分析数据的几何特征来深入理解生物医学现象。
2. 脑胶质瘤(GBM)肿瘤形状分析
2.1 研究背景
脑胶质瘤(GBM)是一种严重的脑部疾病,研究其肿瘤形状有助于了解肿瘤的生长模式和形状异质性,这些特征与体素强度值互补,还可能增强对疾病预后的理解并帮助预测治疗成功的可能性。
2.2 数据来源
成像数据是癌症影像存档的一部分,肿瘤形状通过半自动分割获得,研究选取了63个GBM肿瘤轮廓,将其表示为平面闭合曲线。
2.3 分析方法
- 测地线路径可视化 :通过可视化两个肿瘤形状之间的测地线路径,若路径端点是同一受试者不同时间点的肿瘤,路径上的点可视为肿瘤生长不同阶段的插值,帮助从业者回顾性了解肿瘤的演变;若端点是不同受试者的肿瘤,可帮助定性理解人群中肿瘤形状的差异。
- 主成分分析(PCA) :通过查看整个数据集中的主方向来确定GBM肿瘤形状变异的主要来源。前四个主方向分别捕获了约41%、33%、16%和10%的总变异性,几乎包含了所有的变异,这意味着基于这些主成分的低维模型可用于后续的统计分析。
2.4 分析结果
不同受试者的肿瘤形状差异主要体现在突起的圆润或细长程度上,这是GBM肿瘤形状变异的主要来源。
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