Ubuntu安装BWA和samtools

最新推荐文章于 2024-10-10 08:36:29 发布
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这篇博客详细介绍了在Ubuntu系统中如何安装BWA和samtools，包括安装zlib1g-dev依赖，以及BWA和samtools的下载、解压、编译和安装步骤。在遇到安装问题时，提到了可能需要安装libncurses5-dev，如果所有尝试失败，可以通过sudo apt-get install samtools直接安装。

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Ubuntu安装BWA和samtools时通常需要提前安装zlib.h而centos并不需要。 

安装命令：apt-get install zlib1g-dev

BWA下载地址:    https://sourceforge.net/projects/bio-bwa/files/

解压：tar -xjvf bwa-0.7.15

cd bwa-0.7.15

less INSTALL

less README

可查看文件安装方法

make命令即可安装。

Samtools下载地址：https://sourceforge.net/projects/samtools/files/samtools/

解压：tar -xjvf samtools-1.3

cd samtools-1.3

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