Xron

最新推荐文章于 2025-06-05 22:51:46 发布
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Xron (ˈkairɑn) 是一个甲基化碱基调用器，可以从ONT直接RNA测序中识别m6A甲基化修饰。
使用深度学习CNN+RNN+CTC结构来建立端到端的碱基调用。
名称继承自Chiron
基于 PyTorch 和 python 3.8+ 构建

如果您在使用Xron时遇到任何问题，请在仓库中提交问题。

m6A感知RNA碱基调用一行命令：

xron call -i <input_fast5_folder> -o <output_folder> -m models/ENEYFT --boostnano

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