TransDecoder识别转录本中编码区并预测蛋白
TransDecoder可以识别转录本序列中的编码区域,如:Trinity从头组装、Tophat和Cufflinks将RNA-Seq比对到基因组转录本结果TransDecoder 基于以下标准识别可能的编码序列: 1) 在转录本序列中需要能够找到一个(满足)最小(限定)长度的ORF; 2) 对数似然数得分大于0。(与GeneID软件计算得到的得分相类似); 3...
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2018-04-06 20:37:05 ·
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