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saghir
这个作者很懒,什么都没留下…
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NGS项目五:用R语言生成极端嗜盐古菌蛋白序列进化树
基因表达数据分析和实验设计密不可分,总体来说,实验设计有两大类思路:一类是时间序列分析,主要思想是测定基因多个时间点的表达值,通过聚类和主成分分析等分析手段寻找调控基因,进而研究其深层机制;第二类是基因表达差异的限制性分析。 所谓GO注释,就是将表示基因或其产物的ID映射到一组GO的ID上,用这组GOterm来描述这个基因。而实际应用中,人们更关心一组基因(比如差异表达基因)的共翻译 2015-06-08 09:25:31 · 4349 阅读 · 0 评论 -
R语言——生物统计
首先回顾一些生物统计学关键词Coefficient of variability Standard deviation B(n,p) p(λ) N(μ,σ2) χ2分布 t分布 F分布 假设检验 单/双尾检验 F检验 T检验 χ2检验 方差分析 LSD SSR R语言与统计分析 第一章 R介绍第二章 R的基本原理与核心第三章 概率与分布第四章 探索性数据分析原创 2015-06-15 15:53:01 · 3518 阅读 · 0 评论 -
SNPassoc全基因组关联分析
WGassociation(SNPassoc)WGassociation()所属R语言包:SNPassoc Whole genome association analysis 全基因组关联分析描述----------D转载 2015-10-08 23:42:20 · 6055 阅读 · 1 评论 -
R语言实战
人不能在同个地方栽两次跟头,那样的生活效率太低。所以我一直以来都保持着随手记录的习惯。现在把近半个月来遇到的关于R语言的错误分享一下,希望能帮助到一些朋友,同时也希望各位朋友把遇到的已解决的、未解决的错误提出来一下,完善彼此的知识点,谢谢!目录:连接数据库报错:negative length vectors are not allowed连接数据库报错:first argu转载 2015-10-12 12:49:48 · 1844 阅读 · 0 评论 -
R语言apply函数族笔记
为什么用apply因为我是一个程序员,所以在最初学习R的时候,当成“又一门编程语言”来学习,但是怎么学都觉得别扭。现在我的看法倾向于,R不是一种通用型的编程语言,而是一种统计领域的软件工具。因此,不能用通用型编程的思维来设计R代码。在Andrew Lim关于R和Python的对比回答中,R是一种面向数组(array-oriented)的语法,它更像数学,方便科学家将数学公式转化为R代码转载 2016-03-17 13:11:11 · 1167 阅读 · 0 评论 -
R语言实战笔记
部分源代码来自网络——如若侵犯了您的权益,请与我联系,我将立刻删除。《R语言实战》(Venables&Ripley(2000)Chambers(2008))总结:脑残地按一定格式调用函数,尽情蹂躏数据。1 R基础在R中,对象(object)是指可以赋值给变量的任何事物,包括常量、数据结构、函数,甚至图形。变量可归结为名义型、有序型或连续型变量。 2 数据的准备可以使用r原创 2016-02-20 17:35:47 · 2501 阅读 · 1 评论 -
R语言入门班
感谢: 吴明昊老师 Swirl包作者 《Elegant Graphics for Dataanlysis》书作者 《R Graphics Cookbook》书作者 第一课 R初体验(12 h)1、安装R2、安装RStudio3.在RStudio下输入以下命令:install.packages("swirl")安装Swirl4、调用Swir原创 2016-03-19 09:06:48 · 3141 阅读 · 0 评论