【高性能计算】HPC概述

  👉引言💎

学习的最大理由是想摆脱平庸,早一天就多一份人生的精彩;迟一天就多一天平庸的困扰。
热爱写作,愿意让自己成为更好的人…


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铭记于心
🎉✨🎉我唯一知道的,便是我一无所知🎉✨🎉

HPC概述

1 概述

  • HPC是科学和工业创新的基础工具, 为科学研究,商业HPC,数据驱动分析等诸多领域提供计算支持
1.1 系统架构

HPC系统主要由 登录节点,计算节点,与储存系统 三部分组成

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  • 硬件平台:

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  • 软件平台:
1.2 主要特点与需求

大部分HPC是计算需求型(主要提供计算能力),同时更多的也是 内存带宽需求型(要求对内存的高速访问)

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  • 1.2.1 对 CPU的要求

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    核数/主频 ,内存带宽,内存容量 ,多核扩展性, 软件兼容 ,结果正确性

    更大核数—>更多线程—>更宽向量—>更高带宽

    • 带宽是 通过核数增加 算力的基础,要保证带宽尽可能大,才能多核扩展时提高线性加速比

    • 核扩展与cpu架构相关,网状架构的扩展性更好

  • 1.2.2 对 内存与存储 的要求

    硬件内存结构大概如下所示:

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    主要需求是 内存容量, 每核内存带宽, 并行存储需求

  • 1.2.3 对 网络传输 的要求

    集群扩展 的消息包 随着集群的规模变大,Message size变小 ,Message number 变多(粒度化)

    • 高带宽低延迟

    • 网卡驱动方面 对于HPC/MPI(针对并行计算机,分布式集群的跨语言通讯协议)通讯的优化

1.3 高性能计算发展的趋势
  • 规模更大(大型高性能科学装置,解决重大的科学研究发现)

  • 负载融合(AI增强

  • 交付简单(服务上云,远程提供)

1.4 主要业务负载与应用

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  • 生命材料科学

    • 分子动力学

    • 基因测序

    • 分子成像

    • 高能物理

  • 数字内容可视化

  • 能源行业

    • 地震资料建模和处理

    • 油藏模拟

    • 风险管理

    • 高频交易

  • 政府科研类

    • Multipe
  • 制造行业

    • 计算流体

    • 碰撞模拟

    • 电磁分析

    • 结构分析

  • 天气预报

    • 数值天气预报

🌹写在最后💖
路漫漫其修远兮,吾将上下而求索!伙伴们,再见!🌹🌹🌹在这里插入图片描述

1 某某汽车高性能计算管理平台系统需求 5 1.1 业务需求分析: 5 2 某某汽车 HPC/CAE云计算中心建设目标、策略及步骤 7 3.1 建设目标与策略 7 3.2 建设步骤 8 3 面向高性能计算中心的资源管理、作业调度系统方案 10 3.1 基于应用的场景分析 10 3.1.1 终端用户通过Compute Manager,提交Fluent批处理计算作业 10 3.1.2 终端用户通过Display Manager,提交需要图形节点支持的图形交互程序 13 3.1.3 终端用户通过Compute Manager,在线查看CAE计算结果中的动画 14 3.1.4 终端用户通过Portal启动其他第三方的虚拟桌面,如Ctrix 15 3.2 某某汽车技术中心 HPC云计算平台管理场景 17 3.2.1 HPC云计算平台管理维护 17 3.2.2 HPC云计算平台软、硬件利用情况监控、统计分析 18 4 澳汰尔PBS Works产品介绍 20 4.1 系统逻辑图 20 4.2 系统物理架构图 22 4.4 PBS Professional产品介绍 25 4.4.1 整合计算资源、方便用户使用 25 4.4.2 可靠性、可用性、可维护性(RAS) 26 4.4.3 贯彻企业服务公约管理模式 29 4.4.4 优化计算资源的使用 29 4.4.5 计算资源管理功能 30 4.4.6 作业调度功能 32 4.4.7 Hooks功能 34 4.4.8 网格计算 35 4.4.9 安全认证 35 4.5 PAS(PBS 应用服务) 37 4.6 Compute Manager 40 4.6.1 三员管理 41 4.7 Display Manager 42 4.7.1 Display Manager系统架构 44 4.7.2 Display Manager使用体验 45 4.8 PBS Works定制功能 48 4.8.1 菜单布局:通常将布局分为三个模块:计算管理器、集群状态、管理员工具。如果有其他的模块,我们可以方便地集成在这个框架内(awpf)。菜单模块支持用户访问控制。 48 4.8.2 集群状态监控:统计所有计算节点的运行状态、节点类型、应用程序、物理内存、实际使用内存、内存使用率、节点利用率等信息。磁盘信息和实际CPU利用率,通过数字的颜色来反应使用程度:0%<X<30%(绿色),30%<X<50%(蓝色),50%<X<80%(橙色),80%<X>在线设置或修改节点上绑定的applications 50 4.8.5 管理员工具>>用户统计:用户名称,作业总数,运行作业个数,排队作业个数,申请cpu核数,使用cpu核数,排队cpu核数等信息。申请cpu总资源比,通过数字的颜色来反应使用程度:0%<X<30%(绿色),30%<X<50%(蓝色),50%<X<80%(橙色),80%<X>作业管理:统计作业号、作业名称、用户、软件、节点数、核数、状态、开始时间、优先级等信息。当作业排队状态时,允许修改作业的优先级。另外管理员也可以删除任意作业。 51 4.8.7 管理员工具>>监控作业排队原因 51 4.8.8 管理员工具>>一周作业统计: 统计当天到过去一周内所累积的运行和排队作业个数。 51 4.8.9 管理员工具>>求解器使用情况统计:统计每个求解器提交的作业总数,在运行的作业,请求的cpu,排队cpu,使用cpu等信息。 52 4.8.10 管理员工具>>磁盘统计:通过WEB页面随时了解本地磁盘的使用情况。使用百分率,通过数字的颜色来反应使用程度:0%<X<30%(绿色),30%<X<50%(蓝色),50%<X<80%(橙色),80%<X>项目管理项:管理员可以以项目为单位,设定项目编号、项目名称、项目的开始和结束时间,项目组人员和项目的优先级。当有紧急的项目,管理员可以把项目的优先级提高,并可以把相应的用户加到项目组中,以此提高项目组成员的作业优先级。用户在Web Portal页面提交作业可以选择项目名称,并且只能选择自己所属项目的项目名称。 53 4.8.12 管理员工具>>作业委托管理: 统计当前用户自己所提交的作业总数,包含:作业号,作业名称,具体用户,使用的软件,使用节点数,作业状态等信息,用户可以把自己的一部分作业或所有作业委托给其他用户. 53 4.8.13 管理员工具>> CPU资源份额调整: 统计所有队列下每个用户的软份额限制,硬份额限制(软限制>整体HPC计算资源实时使用统计: 统计当前所有高性能机器集群的计算资源数目,运行状况,存储等使用情况。 54 4.8.15 管理员工具>> WEB版FTP大文件上传: 招标书中明确要求提供基于网页版的FTP上传工具,方便上传大文件。 55 4.8.16 portal用户密码校验: 为了安全保密,当用户在登陆portal的时候,连续5此输入密码错误,系统会冻结用户。直到一段时间后,方可再次登陆。 55 4.9 报表工具PBS Analytics介绍 56 4.9.1 Analytics架构 56 4.9.2 Analytics功能说明 57 4.9.3 Analytics实际案例分析 57 4.10 SAO解决方案 59 4.10.1 SAO架构 60 5 PBS支持仿真软件 61 5.1 CAE领域中支持软件分类及特点 61 5.2 CAE领域中支持软件及介绍 61 5.3 CFD领域中支持软件及介绍 63 5.4 其他领域及自研软件 64 6 和其他作业调度系统的比较优势 65 6.1 Top100超级计算中心占有率对比 65 6.2 Display Manager让用户的仿真整个过程从工作站到了云端 65 6.3 针对大规模计算中心之功能特性 67 6.4 领域知识对比(并有能力帮助HPC中心建立围绕计算的业务能力) 68 7 成功案例 68 7.1 汽车行业用户列表 68 7.2 成功案例-泛亚汽车(通用设计中心) 69 7.3 PBS在中国实施的大规模计算案例 71 7.4 PBS在全球实施的大规模计算案例 72 8 平台架构与软硬件配置建议 72 8.1 硬件平台选型常见误区 72 8.2 cpu架构的选择 73 8.3 计算网络的选择 76 8.4 存储系统的选择 79 8.5 GPU的选择 80 8.6 节点类型的选择 87 8.7 操作系统的选择 87 8.8 并行文件系统的选择 88 8.9 PBS Professional的数据流控制 89 8.10 推荐配置 90 9 硬件常见测试 92 9.1 性能峰值能力测试点 92 9.2 测试压力估算 92 9.2.1 估算结果 92 9.2.1.1. 性能峰值能力测试估算 92 9.3 测试完成准则 93 9.4 测试风险 93 9.5 测试策略 93 9.6 测试用例详细 93 9.6.1 术语 93 9.6.2 性能测试用例描述 94 9.6.2.1. 机群性能测试描述 94 10 Altair介绍 96
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