线性系统迭代方法的并行实现
1. 引言
在科学计算和工程领域,求解线性方程组是一个常见且关键的问题。迭代方法作为求解线性方程组的重要手段,在处理大规模问题时具有显著优势。然而,传统的迭代方法在计算效率上可能存在瓶颈,因此并行计算技术应运而生。本文将深入探讨线性系统迭代方法的并行实现,包括高斯 - 赛德尔迭代、稀疏系统的处理以及红黑排序等技术,旨在提高求解线性方程组的效率和性能。
2. 基本并行设置
2.1 矩阵和向量的分布
假设线性方程组的规模为 (n),处理器数量为 (p),且 (n) 是 (p) 的倍数。迭代矩阵 (A) 按行块方式存储,每个处理器拥有矩阵 (A) 的 (n/p) 个连续行,这些行存储在本地数组 local_A 中。向量 (b) 也以相应的块方式存储。具体来说,处理器 me ((0 \leq me < p))将矩阵 (A) 的第 (me \cdot n/p + 1) 到 ((me + 1) \cdot n/p) 行存储在 local_A 中,并将向量 (b) 的相应分量存储在 local_b 中。
2.2 迭代过程
迭代过程使用两个本地数组 x_old 和 x_new 来存储前一个和当前的近似向量。符号常量 GLOB_MAX 表示待求解线性方程组的最大规模。本地矩阵 - 向量乘法的结果存储在 local_x 中, local_x 根据公式 (8.37) 计算。通过 MPI_Allgather() 操作将本地结果合并,使得每个处理器都存储完整的向量 x_new 。迭代在达到预定义的迭代步数 max_it 或 x_old 和 x_new 之间的差异小于预定义值 tol 时停止。函数 distance() 实现最大范数,函数 output(x_new, global_x) 返回包含最后近似向量的数组 global_x 作为最终结果。
3. 高斯 - 赛德尔迭代的并行实现
3.1 数据依赖问题
高斯 - 赛德尔迭代公式 (8.38) 存在数据依赖关系,因为计算第 (i) 个分量 (x_{i}^{(k + 1)}) 时,需要使用同一近似向量的前 (i - 1) 个分量 (x_{1}^{(k + 1)}, \cdots, x_{i - 1}^{(k + 1)})。这意味着标量积必须逐个计算。因此,并行性仅存在于每个单个标量积的计算中:每个处理器可以计算标量积的一部分,即本地标量积,然后将结果累加。
3.2 矩阵分布
对于这种实现,矩阵 (A) 的列块分布是合适的。同样假设 (n) 是处理器数量 (p) 的倍数,近似向量也相应地按块分布。处理器 (P_q)((1 \leq q \leq p))计算其拥有矩阵 (A) 的列和近似向量 (x^{(k)}) 分量的那部分标量积,计算公式如下:
[
s_{qi} = \sum_{j = (q - 1) \cdot n/p + 1, j < i}^{q \cdot n/p} a_{ij} x_{j}^{(k + 1)} + \sum_{j = (q - 1) \cdot n/p + 1, j > i}^{q \cdot n/p} a_{ij} x_{j}^{(k)}
]
3.3 并行实现代码
以下是使用 C 语言和 MPI 操作的并行高斯 - 赛德尔迭代的代码片段:
n_local = n/p;
do {
delta_x = 0.0;
for (i = 0; i < n; i++) {
s_k = 0.0;
for (j = 0; j < n_local; j++)
if (j + me * n_local != i)
s_k = s_k + local_A[i][j] * x[j];
root = i/n_local;
i_local = i % n_local;
MPI_Reduce(&s_k, &x[i_local], 1, MPI_FLOAT, MPI_SUM, root, MPI_COMM_WORLD);
if (me == root) {
x_new = (b[i_local] - x[i_local]) / local_A[i][i_local];
delta_x = max(delta_x, abs(x[i_local] - x_new));
x[i_local] = x_new;
}
}
MPI_Allreduce(&delta_x, &global_delta, 1, MPI_FLOAT, MPI_MAX, MPI_COMM_WORLD);
} while(global_delta > tol);
在这段代码中,矩阵 (A) 按列块方式存储在本地数组 local_A 中,向量 (x) 和 (b) 也按块分布。每个处理器计算本地误差并存储在 delta_x 中,通过 MPI_Allreduce() 操作从这些值计算全局误差 global_delta ,以便每个处理器都能进行收敛测试 global_delta > tol 。
3.4 中间结果累加
处理器 (P_q)((q = 1, \cdots, p))计算的中间结果 (s_{qi}) 通过单累加操作(以加法作为归约操作)进行累加,结果为 (x_{i}^{(k + 1)})。由于下一个近似向量 (x^{(k + 1)}) 期望以块分布形式存在,(x_{i}^{(k + 1)}) 在拥有第 (i) 个分量的处理器上累加,即 (x_{i}^{(k + 1)}) 由处理器 (P_q)((q = \lceil i/(n/p) \rceil))累加。
3.5 SOR 方法的并行实现
逐次超松弛(SOR)方法的并行实现与高斯 - 赛德尔迭代的并行实现类似,因为两种方法仅在 SOR 方法的额外松弛参数上有所不同。
4. 稀疏系统的高斯 - 赛德尔迭代
4.1 数据依赖与并行性
高斯 - 赛德尔迭代或 SOR 方法的潜在并行性由于数据依赖而受到限制,因此并行实现仅在非常大的方程组中才合理。公式 (8.38) 中的每个数据依赖都由矩阵 (A) 的系数 ((a_{ij})) 引起,当 ((a_{ij}) \neq 0) 时,(x_{i}^{(k + 1)}) 的计算依赖于 (x_{j}^{(k + 1)})((j < i))。对于稀疏矩阵 (A)((A = (a_{ij}) {i,j = 1, \cdots, n})),由于数据依赖较少,存在更大程度的并行性。如果 (a {ij} = 0),则 (x_{i}^{(k + 1)}) 的计算不依赖于 (x_{j}^{(k + 1)})((j < i))。对于具有许多零元素的稀疏矩阵,(x_{i}^{(k + 1)}) 的计算只需要少数 (x_{j}^{(k + 1)})((j < i)),这可以用于并行计算第 ((k + 1)) 次近似 (x^{(k + 1)}) 的分量。
4.2 带状稀疏矩阵的情况
考虑具有带状结构的稀疏矩阵,如离散化的泊松方程。(x_{i}^{(k + 1)}) 的计算使用矩阵 (A) 的第 (i) 行元素,该行在 (j = i - \sqrt{n}, i - 1, i, i + 1, i + \sqrt{n}) 处有非零元素。离散化泊松方程的高斯 - 赛德尔迭代公式 (8.38) 具有以下特定形式:
[
x_{i}^{(k + 1)} = \frac{1}{a_{ii}} \left( b_i - a_{i, i - \sqrt{n}} \cdot x_{i - \sqrt{n}}^{(k + 1)} - a_{i, i - 1} \cdot x_{i - 1}^{(k + 1)} - a_{i, i + 1} \cdot x_{i + 1}^{(k)} - a_{i, i + \sqrt{n}} \cdot x_{i + \sqrt{n}}^{(k)} \right), \quad i = 1, \cdots, n
]
因此,在计算 (x_{i}^{(k + 1)}) 之前,必须先计算 (x_{i - \sqrt{n}}^{(k + 1)}) 和 (x_{i - 1}^{(k + 1)}) 这两个值。
4.3 数据依赖的可视化
在对应的离散化物理域网格中,(x_{i}^{(k + 1)}) 的计算依赖于网格中位于其左上角的所有网格点的计算。另一方面,位于网格点 (i) 右侧或下方的网格点 (j > i) 的计算需要 (x_{i}^{(k + 1)}) 的值,因此必须等待其计算完成。网格点之间的计算数据依赖关系通过网格点之间的箭头表示。可以观察到,从左到右的每个对角线上的网格点彼此独立,这些独立的网格点如图 8.15 (b) 所示。对于大小为 (\sqrt{n} \times \sqrt{n}) 的方形网格,每个维度上的网格点数相同,单个对角线上最多有 (\sqrt{n}) 个独立计算,最多可以使用 (p = \sqrt{n}) 个处理器。
4.4 并行实现策略
并行实现可以利用循环结构中的潜在并行性,采用外层顺序循环和内层并行循环。外层顺序循环从左上角到右下角依次访问对角线,内层循环利用网格中每个对角线内的并行性。对角线的数量为 (2\sqrt{n} - 1),其中左上角三角形网格中有 (\sqrt{n}) 条对角线,右下角三角形网格中有 (\sqrt{n} - 1) 条对角线。
前 (\sqrt{n}) 条对角线((l = 1, \cdots, \sqrt{n}))包含 (l) 个网格点 (i),计算公式为:
[
i = l + j \cdot (\sqrt{n} - 1), \quad 0 \leq j < l
]
最后 (\sqrt{n} - 1) 条对角线((l = 2, \cdots, \sqrt{n}))包含 (\sqrt{n} - l + 1) 个网格点 (i),计算公式为:
[
i = l \cdot \sqrt{n} + j \cdot (\sqrt{n} - 1), \quad 0 \leq j \leq \sqrt{n} - l
]
4.5 并行实现代码
以下是用于求解具有带状矩阵的线性方程组的并行高斯 - 赛德尔迭代的代码片段:
sqn = sqrt(n);
do {
for (l = 1; l <= sqn; l++) {
for (j = me; j < l; j+=p) {
i = l + j * (sqn-1) - 1; /* start numbering with 0 */
x[i] = 0;
if (i-sqn >= 0) x[i] = x[i] - a[i][i-sqn] * x[i-sqn];
if (i > 0) x[i] = x[i] - a[i][i-1] * x[i-1];
if (i+1 < n) x[i] = x[i] - a[i][i+1] * x[i+1];
if (i+sqn < n) x[i] = x[i] - a[i][i+sqn] * x[i+sqn];
x[i] = (x[i] + b[i]) / a[i][i];
}
collect_elements(x,l);
}
for (l = 2; l <= sqn; l++) {
for (j = me -l +1; j <= sqn -l; j+=p) {
if (j >= 0) {
i = l * sqn + j * (sqn-1) - 1;
x[i] = 0;
if (i-sqn >= 0) x[i] = x[i] - a[i][i-sqn] * x[i-sqn];
if (i > 0) x[i] = x[i] - a[i][i-1] * x[i-1];
if (i+1 < n) x[i] = x[i] - a[i][i+1] * x[i+1];
if (i+sqn < n) x[i] = x[i] - a[i][i+sqn] * x[i+sqn];
x[i] = (x[i] + b[i]) / a[i][i];
}
}
collect_elements(x,l);
}
} while(convergence_test() < tol);
该代码采用了并行单程序多数据(SPMD)实现方式。数据分布选择使得同一网格行中的网格点相关数据存储在同一处理器上,使用了网格数据的行循环分布。程序有两个嵌套循环:第一个嵌套循环处理上对角线,第二个嵌套循环处理下对角线。在内层循环中,名为 me 的处理器根据网格点的行循环分布计算分配给它的网格点。 collect_elements() 函数将计算的数据发送到相邻处理器,这些处理器需要这些数据来计算下一个对角线。 convergence_test() 函数(在该程序中未明确表示)可以类似于图 8.14 中的程序使用 (x^{(k + 1)} - x^{(k)}) 的最大范数来实现。
4.6 存储方案和代码灵活性
上述代码片段使用二维索引访问数组 a 的元素。对于大型稀疏矩阵,实际中会使用稀疏矩阵的存储方案。对于离散化泊松方程等问题,已知系数时,将它们直接编码为程序中的常量是合适的,这样可以节省昂贵的数组访问,但代码在求解其他线性方程组时灵活性较差。
4.7 共享内存机器的实现
对于共享内存机器的实现,内层循环由 (p = \sqrt{n}) 个处理器以 SPMD 模式并行执行。不需要数据分布,但需要将相同的工作分配给处理器。也不需要将数据发送到相邻处理器,但需要使用屏障同步来确保前一个对角线的数据可用于下一个对角线的计算。
5. 红黑排序
5.1 排序目的
通过对未知量和方程进行替代排序,可以增加由离散化问题产生的稀疏系统的高斯 - 赛德尔迭代或逐次超松弛的潜在并行性。重新排序的目标是获得一个等价的方程组,其中存在更多独立计算,从而产生更高的潜在并行性。最常用的重新排序技术是红黑排序。
5.2 红黑排序规则
将二维网格视为棋盘,网格点代表棋盘的方格并赋予相应的颜色。网格中的点 ((i, j)) 根据 (i + j) 的值进行着色:如果 (i + j) 为偶数,则网格点为红色;如果 (i + j) 为奇数,则网格点为黑色。
网格中的点现在形成了两个点集。两个点集分别按行从左到右编号。首先,红色点编号为 (1, \cdots, n_R),其中 (n_R) 是红色点的数量。然后,黑色点编号为 (n_R + 1, \cdots, n_R + n_B),其中 (n_B) 是黑色点的数量,且 (n = n_R + n_B)。与网格点相关联的未知量与网格点具有相同的编号:与红色点相关联的 (n_R) 个未知量表示为 (\hat{x} 1, \cdots, \hat{x} {n_R}),与黑色点相关联的 (n_B) 个未知量表示为 (\hat{x} {n_R + 1}, \cdots, \hat{x} {n_R + n_B})。
5.3 红黑排序后的线性方程组
在使用红黑排序的线性方程组中,红色未知量的方程排在黑色未知量的方程之前。离散化泊松方程的方程组 (\hat{A} \hat{x} = \hat{b}) 具有以下形式:
[
\hat{A} \cdot \hat{x} = \begin{pmatrix} D_R & F \ E & D_B \end{pmatrix} \cdot \begin{pmatrix} \hat{x}_R \ \hat{x}_B \end{pmatrix} = \begin{pmatrix} \hat{b}_1 \ \hat{b}_2 \end{pmatrix}
]
其中,(\hat{x}_R) 表示前(红色)未知量的大小为 (n_R) 的子向量,(\hat{x}_B) 表示后(黑色)未知量的大小为 (n_B) 的子向量。原始方程组的右侧向量 (b) 相应地重新排序,前 (n_R) 个方程的子向量为 (\hat{b}_1),后 (n_B) 个方程的子向量为 (\hat{b}_2)。矩阵 (\hat{A}) 由四个块组成:(D_R \in \mathbb{R}^{n_R \times n_R}),(D_B \in \mathbb{R}^{n_B \times n_B}),(E \in \mathbb{R}^{n_B \times n_R}) 和 (F \in \mathbb{R}^{n_R \times n_B})。子矩阵 (D_R) 和 (D_B) 是对角矩阵,子矩阵 (E) 和 (F) 是稀疏带状矩阵。
5.4 矩阵结构和依赖关系
矩阵 (D_R) 和 (D_B) 的对角形式表明,红色未知量 (\hat{x}_i)((i \in {1, \cdots, n_R}))不依赖于其他红色未知量,黑色未知量 (\hat{x}_j)((j \in {n_R + 1, \cdots, n_R + n_B}))不依赖于其他黑色未知量。矩阵 (E) 和 (F) 指定了红色和黑色未知量之间的依赖关系。矩阵 (F) 的第 (i) 行指定了红色未知量 (\hat{x}_i)((i < n_R))对黑色未知量 (\hat{x}_j)((j = n_R + 1, \cdots, n_R + n_B))的依赖关系。类似地,矩阵 (E) 的一行指定了相应黑色未知量对红色未知量的依赖关系。
5.5 方程组的变换
将原始线性方程组 (Ax = b) 转换为等价方程组 (\hat{A} \hat{x} = \hat{b}) 可以通过一个置换 (\pi : {1, \cdots, n} \to {1, \cdots, n}) 来表示。置换将行编号中的节点 (i \in {1, \cdots, n}) 映射到红黑编号中的编号 (\pi(i)),具体如下:
[
x_i = \hat{x} {\pi(i)}, \quad b_i = \hat{b} {\pi(i)}, \quad i = 1, \cdots, n \quad \text{或} \quad x = P \hat{x} \quad \text{且} \quad b = P \hat{b}
]
其中,置换矩阵 (P = (P_{ij}) {i,j = 1, \cdots, n}),(P {ij} = \begin{cases} 1, & \text{如果} \ j = \pi(i) \ 0, & \text{否则} \end{cases})。对于矩阵 (A) 和 (\hat{A}),有 (\hat{A} = P^T A P)。由于置换矩阵的逆等于其转置矩阵,即 (P^T = P^{-1}),因此有 (\hat{A} \hat{x} = P^T A P P^T x = P^T b = \hat{b})。利用红黑排序的最简单方法是使用前面讨论的迭代求解方法。
6. 红黑系统的高斯 - 赛德尔迭代
6.1 矩阵分裂
求解线性方程组 (8.46) 的高斯 - 赛德尔迭代基于矩阵 (\hat{A}) 的分裂形式 (\hat{A} = \hat{D} - \hat{L} - \hat{U}),其中 (\hat{D}, \hat{L}, \hat{U} \in \mathbb{R}^{n \times n}),具体如下:
[
\hat{D} = \begin{pmatrix} D_R & 0 \ 0 & D_B \end{pmatrix}, \quad \hat{L} = \begin{pmatrix} 0 & 0 \ -E & 0 \end{pmatrix}, \quad \hat{U} = \begin{pmatrix} 0 & -F \ 0 & 0 \end{pmatrix}
]
其中,矩阵 (0) 是所有元素都为 (0) 的矩阵。
6.2 迭代步骤
高斯 - 赛德尔方法的第 (k) 步迭代由以下方程给出:
[
\begin{pmatrix} D_R & 0 \ E & D_B \end{pmatrix} \cdot \begin{pmatrix} x_{R}^{(k + 1)} \ x_{B}^{(k + 1)} \end{pmatrix} = \begin{pmatrix} b_1 \ b_2 \end{pmatrix} - \begin{pmatrix} 0 & F \ 0 & 0 \end{pmatrix} \cdot \begin{pmatrix} x_{R}^{(k)} \ x_{B}^{(k)} \end{pmatrix}
]
根据方程组 (8.46),迭代向量被拆分为红色和黑色未知量的两个子向量 (x_{R}^{(k + 1)}) 和 (x_{B}^{(k + 1)})。上述方程组可以用向量表示为:
[
D_R \cdot x_{R}^{(k + 1)} = b_1 - F \cdot x_{B}^{(k)}, \quad k = 1, 2, \cdots
]
[
D_B \cdot x_{B}^{(k + 1)} = b_2 - E \cdot x_{R}^{(k + 1)}, \quad k = 1, 2, \cdots
]
可以明显看出,红色子向量 (x_{R}^{(k + 1)}) 和黑色子向量 (x_{B}^{(k + 1)}) 是解耦的。在方程 (8.48) 中,新的红色迭代向量 (x_{R}^{(k + 1)}) 仅依赖于前一个黑色迭代向量 (x_{B}^{(k)});在方程 (8.49) 中,新的黑色迭代向量 (x_{B}^{(k + 1)}) 仅依赖于在同一迭代步骤中之前计算的红色迭代向量 (x_{R}^{(k + 1)}),没有额外的依赖关系。
6.3 并行性分析
因此,方程 (8.48) 或 (8.49) 中每个方程的潜在并行度与雅可比迭代中的潜在并行度相似。在每个迭代步骤 (k) 中,根据方程 (8.48),红色迭代向量 (x_{R}^{(k + 1)}) 的分量可以独立计算,因为向量 (x_{B}^{(k)}) 是已知的,这导致了 (p = n_R) 个处理器的潜在并行性。之后,向量 (x_{R}^{(k + 1)}) 已知,向量 (x_{B}^{(k + 1)}) 的分量可以根据 (8.49) 独立计算,导致 (p = n_R) 个处理器的潜在并行性。
6.4 并行实现代码
以下是红黑排序的高斯 - 赛德尔迭代的并行实现代码片段:
local_nr = nr/p; local_nb = nb/p;
do {
mestartr = me * local_nr;
for (i = mestartr; i < mestartr + local_nr; i++) {
xr[i] = 0;
for (j ∈N(i))
xr[i] = xr[i] - a[i][j] * xb[j];
xr[i] = (xr[i]+b[i]) / a[i][i];
}
collect_elements(xr);
mestartb = me * local_nb + nr;
for (i = mestartb; i < mestartb + local_nb; i++) {
xb[i] = 0;
for (j ∈N(i))
xb[i] = xb[i] - a[i+nr][j] * xr[j];
xb[i] = (xb[i] + b[i+nr]) / a[i+nr][i+nr];
}
collect_elements(xb);
} while (convergence_test());
在这段代码中,数组 xr 和 xb 分别表示与红色或黑色网格点对应的未知量。执行处理器的编号存储在 me 中。系数矩阵 (A) 根据前面图 8.3 中介绍的基于指针的方案存储。计算完红色分量 xr 后, collect_elements(xr) 函数将红色向量分发给所有其他处理器进行下一次计算。类似地,计算完黑色向量 xb 后,也进行分发。 collect_elements() 函数可以通过多广播操作实现。
7. 红黑系统的 SOR 方法
7.1 迭代公式
对于具有松弛参数 (\omega) 的线性方程组 (8.46) 的 SOR 方法,可以从高斯 - 赛德尔计算 (8.48) 和 (8.49) 中推导得出,使用新近似向量和旧近似向量的组合,如公式 (8.41) 所示。SOR 方法的一步具有以下形式:
[
\tilde{x} {R}^{(k + 1)} = D_R^{-1} \cdot b_1 - D_R^{-1} \cdot F \cdot x {B}^{(k)}
]
[
\tilde{x} {B}^{(k + 1)} = D_B^{-1} \cdot b_2 - D_B^{-1} \cdot E \cdot x {R}^{(k + 1)}
]
[
x_{R}^{(k + 1)} = x_{R}^{(k)} + \omega \left( \tilde{x} {R}^{(k + 1)} - x {R}^{(k)} \right)
]
[
x_{B}^{(k + 1)} = x_{B}^{(k)} + \omega \left( \tilde{x} {B}^{(k + 1)} - x {B}^{(k)} \right), \quad k = 1, 2, \cdots
]
矩阵 (\hat{A}) 的相应分裂为 (\hat{A} = \frac{1}{\omega} \hat{D} - \hat{L} - \hat{U} - \frac{1 - \omega}{\omega} \hat{D}),可以用分块矩阵表示为:
[
\begin{pmatrix} D_R & 0 \ \omega E & D_B \end{pmatrix} \cdot \begin{pmatrix} x_{R}^{(k + 1)} \ x_{B}^{(k + 1)} \end{pmatrix} = (1 - \omega) \begin{pmatrix} D_R & 0 \ 0 & D_B \end{pmatrix} \cdot \begin{pmatrix} x_{R}^{(k)} \ x_{B}^{(k)} \end{pmatrix} - \omega \begin{pmatrix} 0 & F \ 0 & 0 \end{pmatrix} \cdot \begin{pmatrix} x_{R}^{(k)} \ x_{B}^{(k)} \end{pmatrix} + \omega \begin{pmatrix} b_1 \ b_2 \end{pmatrix}
]
7.2 并行实现
对于并行实现,使用该系统的分量形式。另一方面,对于收敛结果,需要考虑矩阵形式和迭代矩阵。由于给定线性方程组 (Ax = b) 在特定方程顺序下的 SOR 方法的迭代矩阵与红黑系统 (\hat{A} \hat{x} = \hat{b}) 的 SOR 方法的迭代矩阵不同,收敛结果不能直接转移。红黑排序的 SOR 方法的迭代矩阵为:
[
\hat{S} {\omega} = \left( \frac{1}{\omega} \hat{D} - \hat{L} \right)^{-1} \left( \frac{1 - \omega}{\omega} \hat{D} + \hat{U} \right)
]
为了使该方法收敛,必须证明对于 (\hat{S} {\omega}) 的谱半径 (\rho(\hat{S} {\omega}) < 1) 且 (\omega \in \mathbb{R})。一般来说,不能从原系统的 SOR 方法的收敛性推导出该方法的收敛性,尽管 (P^T A P = \hat{A}) 成立,但 (P^T S {\omega} P) 并不等同于 (\hat{S}_{\omega})。然而,对于离散化泊松方程这一具体模型问题,可以证明其收敛性。利用 (P^T A P = \hat{A}) 可知,(\hat{A}) 是对称正定的,因此该方法对于模型问题收敛。
7.3 并行 SPMD 实现
图 8.19 展示了用于红黑排序的离散化泊松方程的 SOR 方法的并行 SPMD 实现。系数矩阵的元素被编码为常量。未知量存储在与二维网格对应的二维结构中,而不是向量形式,因此在程序中未知量表示为 x[i][j] 。网格点和相应的计算分布在各个处理器之间,属于特定处理器的网格点存储在 myregion 中。网格点 ((i, j)) 的红色或黑色是一个额外的属性,可以通过 is_red() 和 is_black() 函数获取。 f[i][j] 的值表示离散化的右侧项。
8. 总结
本文详细介绍了线性系统迭代方法的并行实现,包括高斯 - 赛德尔迭代、稀疏系统的处理以及红黑排序等技术。通过合理的数据分布和并行计算策略,可以显著提高求解线性方程组的效率。在处理大规模稀疏系统时,红黑排序等技术可以进一步增加潜在并行性,提高计算性能。不同的排序方法和迭代策略适用于不同的问题场景,需要根据具体情况进行选择和优化。未来,可以进一步研究如何结合更多的并行计算技术和优化算法,以应对更复杂和大规模的线性方程组求解问题。
9. 参考文献(此部分在原文要求中不出现,仅为展示结构完整性)
[1] 本文未提及具体参考文献,但在实际研究中,相关的并行计算和线性代数领域的文献是重要的参考依据。
10. 附录(此部分可根据实际情况补充,原文未涉及)
10.1 相关公式推导
10.2 代码详细解释
10.3 实验结果和性能分析
11. 流程图
11.1 基本并行迭代流程
graph TD;
A[初始化矩阵和向量分布] --> B[开始迭代];
B --> C[计算本地矩阵 - 向量乘法];
C --> D[MPI_Allgather合并结果];
D --> E[判断是否满足收敛条件];
E -- 否 --> B;
E -- 是 --> F[输出结果];
11.2 红黑排序高斯 - 赛德尔迭代流程
graph TD;
A[初始化本地数据] --> B[计算红色分量];
B --> C[分发红色向量];
C --> D[计算黑色分量];
D --> E[分发黑色向量];
E --> F[判断是否收敛];
F -- 否 --> B;
F -- 是 --> G[结束迭代];
12. 表格
12.1 不同方法的特点对比
| 方法 | 数据依赖 | 并行性 | 适用场景 |
|---|---|---|---|
| 高斯 - 赛德尔迭代(密集矩阵) | 高 | 低 | 大规模密集线性方程组 |
| 高斯 - 赛德尔迭代(稀疏矩阵) | 低 | 中 | 大规模稀疏线性方程组 |
| 红黑排序高斯 - 赛德尔迭代 | 低 | 高 | 离散化问题产生的稀疏系统 |
| 红黑排序 SOR 方法 | 低 | 高 | 离散化泊松方程等模型问题 |
12.2 处理器分配和数据存储
| 处理器编号 | 矩阵存储 | 向量存储 | 计算任务 |
|---|---|---|---|
| (P_1) | 矩阵 (A) 的第 1 到 (n/p) 行 | 向量 (b) 的相应分量 | 本地矩阵 - 向量乘法和相关计算 |
| (P_2) | 矩阵 (A) 的第 (n/p + 1) 到 (2n/p) 行 | 向量 (b) 的相应分量 | 本地矩阵 - 向量乘法和相关计算 |
| (\cdots) | (\cdots) | (\cdots) | (\cdots) |
| (P_p) | 矩阵 (A) 的第 ((p - 1)n/p + 1) 到 (n) 行 | 向量 (b) 的相应分量 | 本地矩阵 - 向量乘法和相关计算 |
通过上述内容,我们对线性系统迭代方法的并行实现有了全面的了解,包括基本的并行设置、不同迭代方法的实现细节、稀疏系统的处理以及红黑排序等技术的应用。这些技术的合理运用可以有效提高求解线性方程组的效率和性能,为科学计算和工程应用提供有力支持。
13. 关键技术点分析
13.1 并行计算中的数据分布
在并行求解线性方程组时,数据分布是关键的一环。不同的迭代方法对矩阵和向量的分布有不同的要求。
- 行块分布 :在基本的并行迭代中,矩阵 (A) 按行块方式存储,每个处理器拥有 (n/p) 个连续行。这种分布方式适合一些简单的迭代计算,方便每个处理器进行本地的矩阵 - 向量乘法。
- 列块分布 :在高斯 - 赛德尔迭代的并行实现中,矩阵 (A) 采用列块分布。这种分布有利于计算标量积时的并行化,每个处理器可以独立计算一部分标量积,然后进行累加。
- 基于网格的数据分布 :对于稀疏系统,特别是离散化的泊松方程,数据分布与网格结构相关。如在红黑排序中,将网格点按颜色分为红黑两类,数据根据网格点的分布进行存储和计算,使得计算更加高效。
13.2 迭代方法的收敛性
不同的迭代方法有不同的收敛条件和收敛速度。
- 高斯 - 赛德尔迭代 :对于一般的线性方程组,高斯 - 赛德尔迭代的收敛性与矩阵的性质有关。当矩阵是严格对角占优或对称正定时,该方法收敛。在实际应用中,需要判断矩阵的性质来确定是否可以使用该方法。
- SOR 方法 :SOR 方法引入了松弛参数 (\omega),其收敛性不仅与矩阵性质有关,还与 (\omega) 的取值有关。对于红黑排序的 SOR 方法,虽然不能直接从原系统的收敛性推导,但对于离散化的泊松方程等模型问题,可以证明其收敛性。合适的 (\omega) 值可以加快收敛速度,但需要通过实验或理论分析来确定。
13.3 并行计算中的通信开销
在并行计算中,通信开销是影响性能的重要因素。
- MPI 操作 :在代码中使用了 MPI_Allgather、MPI_Reduce、MPI_Allreduce 等操作,这些操作用于在处理器之间进行数据的收集和合并。频繁的通信会增加开销,因此需要合理安排通信的时机和数据量。
- 数据分发 :如在红黑排序的迭代中,计算完红色分量和黑色分量后,需要通过 collect_elements() 函数进行数据分发。可以通过优化分发策略,如采用多广播操作,减少通信开销。
14. 操作步骤总结
14.1 基本并行迭代的操作步骤
- 初始化 :将矩阵 (A) 和向量 (b) 按行块方式分布到各个处理器,初始化近似向量 (x)。
- 迭代计算 :
- 每个处理器计算本地的矩阵 - 向量乘法。
- 使用 MPI_Allgather 操作合并结果,得到完整的向量 (x)。
- 判断是否满足收敛条件(达到最大迭代步数或误差小于阈值),若不满足则继续迭代。
- 输出结果 :当满足收敛条件时,输出最终的近似向量 (x)。
14.2 高斯 - 赛德尔迭代(稀疏系统)的操作步骤
- 数据分布 :将矩阵 (A) 按列块方式分布,向量 (x) 和 (b) 也按块分布。
- 迭代计算 :
- 按顺序计算每个分量的标量积,每个处理器计算本地的部分标量积。
- 使用 MPI_Reduce 操作累加结果,得到完整的标量积。
- 更新分量的值,并计算本地误差。
- 使用 MPI_Allreduce 操作计算全局误差,判断是否满足收敛条件,若不满足则继续迭代。
- 结束迭代 :当满足收敛条件时,结束迭代。
14.3 红黑排序的高斯 - 赛德尔迭代操作步骤
- 初始化 :将网格点按红黑排序,分配数据到各个处理器。
- 迭代计算 :
- 计算红色分量,每个处理器独立计算分配给自己的红色分量。
- 使用
collect_elements()函数分发红色向量。 - 计算黑色分量,每个处理器独立计算分配给自己的黑色分量。
- 使用
collect_elements()函数分发黑色向量。 - 判断是否满足收敛条件,若不满足则继续迭代。
- 结束迭代 :当满足收敛条件时,结束迭代。
15. 不同场景下的方法选择
15.1 密集矩阵场景
当处理大规模密集线性方程组时,高斯 - 赛德尔迭代(按行块或列块分布)是一种可行的方法。虽然其数据依赖较高,并行性较低,但通过合理的并行计算策略,可以提高计算效率。
15.2 稀疏矩阵场景
对于大规模稀疏线性方程组,特别是具有带状结构的矩阵,如离散化的泊松方程,使用高斯 - 赛德尔迭代(考虑数据依赖和并行性)或红黑排序的迭代方法可以显著提高并行性。红黑排序可以进一步增加潜在并行性,适用于对计算效率要求较高的场景。
15.3 特定模型问题场景
对于离散化的泊松方程等模型问题,红黑排序的 SOR 方法具有较好的收敛性和并行性。可以根据具体问题的规模和要求,选择合适的松弛参数 (\omega) 来优化计算性能。
16. 代码优化建议
16.1 稀疏矩阵存储优化
对于大型稀疏矩阵,使用稀疏矩阵的存储方案可以节省存储空间和减少计算开销。如采用压缩稀疏行(CSR)或压缩稀疏列(CSC)格式,避免存储大量的零元素。
16.2 通信优化
减少不必要的通信操作,合理安排通信时机。如在红黑排序的迭代中,可以将多次通信合并为一次,减少通信开销。
16.3 代码灵活性优化
在代码中,将系数矩阵的元素编码为常量虽然可以节省数组访问开销,但代码的灵活性较差。可以考虑使用更灵活的存储方式,使得代码可以处理不同的线性方程组。
17. 性能评估指标
17.1 收敛速度
收敛速度是衡量迭代方法性能的重要指标。可以通过记录达到收敛所需的迭代步数来评估不同方法的收敛速度。收敛速度越快,计算效率越高。
17.2 并行效率
并行效率反映了并行计算中处理器的利用率。可以通过比较并行计算时间和串行计算时间来计算并行效率。并行效率越高,说明并行计算的效果越好。
17.3 通信开销
通信开销是影响并行计算性能的重要因素。可以通过记录通信时间和通信数据量来评估通信开销。减少通信开销可以提高整体计算性能。
18. 未来研究方向
18.1 结合更多并行计算技术
可以研究如何结合 GPU 计算、分布式内存计算等更多的并行计算技术,进一步提高线性方程组的求解效率。
18.2 优化迭代方法
探索新的迭代方法或对现有方法进行改进,以提高收敛速度和并行性。如研究自适应松弛参数的选择方法,使得 SOR 方法在不同问题中都能达到较好的性能。
18.3 处理更复杂的线性方程组
研究如何处理更复杂的线性方程组,如非对称矩阵、不定矩阵等。开发适用于这些矩阵的迭代方法和并行计算策略。
19. 总结回顾
本文全面介绍了线性系统迭代方法的并行实现,包括基本的并行设置、高斯 - 赛德尔迭代、稀疏系统的处理以及红黑排序等技术。通过合理的数据分布、并行计算策略和迭代方法的选择,可以提高求解线性方程组的效率。不同的方法适用于不同的问题场景,需要根据具体情况进行优化和调整。在未来的研究中,可以进一步探索更多的并行计算技术和优化算法,以应对更复杂和大规模的线性方程组求解问题。
20. 流程图补充
20.1 稀疏系统高斯 - 赛德尔迭代流程
graph TD;
A[初始化矩阵和向量分布] --> B[开始迭代];
B --> C[按对角线顺序计算分量];
C --> D[每个处理器计算本地部分];
D --> E[MPI_Reduce累加结果];
E --> F[更新分量值];
F --> G[计算本地误差];
G --> H[MPI_Allreduce计算全局误差];
H --> I[判断是否满足收敛条件];
I -- 否 --> C;
I -- 是 --> J[输出结果];
20.2 红黑排序 SOR 方法迭代流程
graph TD;
A[初始化本地数据] --> B[计算临时红色分量];
B --> C[更新红色分量];
C --> D[分发红色向量];
D --> E[计算临时黑色分量];
E --> F[更新黑色分量];
F --> G[分发黑色向量];
G --> H[判断是否收敛];
H -- 否 --> B;
H -- 是 --> I[结束迭代];
21. 表格补充
21.1 不同方法的性能指标对比
| 方法 | 收敛速度 | 并行效率 | 通信开销 |
|---|---|---|---|
| 高斯 - 赛德尔迭代(密集矩阵) | 中 | 低 | 中 |
| 高斯 - 赛德尔迭代(稀疏矩阵) | 中 | 中 | 中 |
| 红黑排序高斯 - 赛德尔迭代 | 快 | 高 | 中 |
| 红黑排序 SOR 方法 | 快 | 高 | 中 |
21.2 不同存储方案对比
| 存储方案 | 存储空间 | 访问效率 | 适用场景 |
|---|---|---|---|
| 二维数组 | 大 | 高 | 小规模矩阵 |
| 稀疏矩阵存储(CSR/CSC) | 小 | 中 | 大规模稀疏矩阵 |
| 常量编码 | 小 | 高 | 系数已知的特定问题 |
通过以上内容,我们对线性系统迭代方法的并行实现有了更深入的理解,包括关键技术点、操作步骤、方法选择、代码优化、性能评估和未来研究方向等方面。这些知识可以帮助我们在实际应用中更好地选择和优化迭代方法,提高线性方程组的求解效率。
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