宏-物种注释

背景： 将预测得到的基因（核酸序列）注释到nr 数库，可以的得到物种注释结果；

存在的问题： 一个基因可能注释到多个物种；

解决 ：寻找最近公共祖先（即如果一个基因注释到多个物种，但是他们有共同的属，那么认为这个基因注释到了属水平）

数据库：taxonomy

附：

taxid ： NCBI人为的给自然界所有的物种都给了一个编号，其中人类的编号是 9606；

taxid的资料还有很多 ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/taxonomy/

accession2taxid ： ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/taxonomy/accession2taxid/prot.accession2taxid.gz

ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/taxonomy/new_taxdump/new_taxdump.tar.gz

nodes.dmp 这个文件列出了taxid的树的结构信息，子节点，父节点等等

names.dmp 这个文件里面列出了每个独特的taxid对应着的物种名