recher_He1107的博客

介绍分子对接的相互作用特征，以及如何通过这些特征进行目视筛查

介绍schrodinger在无图形化linux集群上的分子对接流程

介绍蛋白结构评估工具PROCHECK的安装和使用

使用schrodinger建立QSAR模型本篇教程将展示如何使用AutoQSAR/DeepChem去设定,建立和理解深度学习QSAR/QSPR模型.文章目录使用schrodinger建立QSAR模型一、深度学习QSAR模型是什么？二、使用步骤1.创立项目引入结构2.建立一个AutoQSAR/DeepChem 模型以预测污染物致突变性.3.分析和使用AutoQSAR/DeepChem 污染物致突变性模型3.1 分析3.2 使用4.分析来自AutoQSAR / Deepchem模型的Ames致突变性的预测

记录一下完整的pharmacophore的过程初始文件复合物晶体结构->PLIF->药效团序列加载蛋白复合物以及初始设置准备1.读取蛋白文件2.修改背景颜色为白色,修改立场文件3.删除多余链与配体4.调整蛋白结构显示5.蛋白分子的预处理叠合蛋白-配体复合物1.为复合物分配不同的颜色以便于区分2.叠合蛋白-配体复合物3.观察蛋白-配体相互作用4.新建Database并导入蛋白-配体复合物生成PLIF和Pharmacophore Query1.生成PLIF2.生成pharmacophore quer