25、数据整理、可视化与关系型数据库入门

数据整理、可视化与关系型数据库入门

1. 数据整理与可视化练习

在数据整理和可视化方面，有几个有趣的练习可以帮助我们提升相关技能。

1.1 鸣禽的生活史

Martin（2015）对温带和热带环境中的鸣禽进行了研究。他发现，在面临较高巢穴捕食风险的物种中，其峰值生长率更高；而对于具有相同风险水平的物种，热带鸣禽的峰值生长率低于温带鸣禽。同时，雏鸟期与生长率相关，在相同生长率下，热带物种的雏鸟期比温带物种更短。
要重现原论文图 2，可以使用 CSB/data_wrangling/data 目录下的 Martin2015_data.csv 文件，参考 Martin2015_figure2.pdf 中的 ggplot2 生成的图形进行操作。

1.2 果蝇科翅膀

Bolstad 等人（2015）研究了果蝇科翅膀长度与横跨翅膀的 L2 静脉长度之间的异速生长关系。他们测量了超过 20,000 个个体，涵盖 111 个物种。在图 1 中，展示了翅膀大小对数与 L2 静脉长度对数之间的回归关系，针对每个物种和性别进行回归分析，并添加了每个物种的平均值点。要重现该图，可以使用 CSB/data_wrangling/data/Boldstad2015_data.csv 文件，参考 data/Bolstad2015_figure1.pdf 中的简化图形。

1.3 灭绝风险的元分析

Urban（2015）对灭绝风险及其与气候变