图神经网络项目的数据处理与获取
1. 图的邻接矩阵特性
对于无向图,其可视化的邻接矩阵沿对角线对称,所有无向图的邻接矩阵都具有对称性。而有向图的邻接矩阵可能对称,但并非必然。
2. 数据预处理与加载到PyG
数据预处理是将数据(包括其属性、标签或其他元数据)转换为适合下游机器学习模型的格式,特征工程也是其中的一个步骤。在特征工程中,常使用图算法来计算节点、边或子图的属性。例如,节点特征可以是介数中心性(Betweenness centrality)。介数中心性是衡量节点重要性的关键指标,它量化了节点位于源节点到目标节点最短路径上的倾向。给定一个有n个节点的图,可以确定图中每对唯一节点之间的最短路径。如果一个节点出现在所有或大多数这些路径中,它的介数中心性就高,被认为具有高度影响力;反之,如果出现次数很少(或仅一次),则介数中心性低,影响力也低。
要计算介数中心性,可以将ETL步骤的输出(如边列表)导入图处理框架,为每个节点计算该值。得到该值后,可以使用以节点ID为键的字典存储,后续作为节点特征使用。
3. PyG中的数据模块
在使用图神经网络(GNN)时,选择了PyG作为框架,因为它拥有强大的工具套件,并且在处理复杂图数据方面具有灵活性。PyG中有三个重要的模块:
- Data模块(torch_geometric.data) :允许检查、操作和创建PyG环境使用的数据对象。
- Utils模块(torch_geometric.utils) :包含许多有用的方法,在数据导入和导出图数据方面很有帮助。
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