超算平台下利用module加载相关模块

environment-modules是一个用于管理用户不同应用的工具，可以动态的加载、移除所安装的应用。

1. 对于root用户的安装命令：（需要管理员权限，普通用户无法安装）

# sudo yum install -y environment-modules

2. 设置环境变量：

安装environment-modules之后，会默认在/usr/share/module目录下产生一系列文件夹，其中init中放了在各种系统下初始化这个程序的脚本。

需要在.bashrc里面设置环境变量,指定modulefiles的路径。其中，module是通过modulefiles来定位安装的软件的位置以及其他路径与环境变量的设置。

# source /usr/share/Modules/init/bash  ！初始化设置

# vi ~/.bashrc

export MODULEPATH=/usr/share/Modules/modulefiles

# source ~/.bashrc

3. 检查

# module avail

4. 编写modulefile（以intel compiler modulefile为例）

#%Module1.0
##
##      intel compiler modulefile
##
proc ModulesHelp { } {
        puts stderr "Sets up the paths you need to use intel compilers."
}

module-whatis "sets the environment variables for intel compiler 12"

conflict icc  
conflict ifort
conflict idb
conflict mkl
conflict intel_tools
conflict intel-compilers

set cmplr_path	/home/apps/intel/composer_xe_2011_sp1.8.273

prepend-path PATH $cmplr_path/bin/intel64
prepend-path LD_LIBRARY_PATH  $cmplr_path/compiler/lib/intel64
prepend-path LIBRARY_PATH  $cmplr_path/compiler/lib/intel64
prepend-path MIC_LD_LIBRARY_PATH $cmplr_path/compiler/lib/mic
prepend-path NLSPATH $cmplr_path/debugger/intel64/locale/%l_%t/%N
prepend-path NLSPATH $cmplr_path/compiler/lib/intel64/locale/%l_%t/%N

# il faut un : a la fin pour que le man cherche dans les autres repertoires 
# il faut parcontre trouver une autre facon au cas ou l'usager n'utilise pas 
# ce module
prepend-path MANPATH $cmplr_path/man/en_US:

set IPPPATH  $cmplr_path/mkl
prepend-path LD_LIBRARY_PATH $IPPPATH/lib/intel64
prepend-path LD_LIBRARY_PATH $IPPPATH/../compiler/lib/intel64
prepend-path LIBRARY_PATH  $IPPPATH/lib/intel64
prepend-path LIBRARY_PATH  $IPPPATH/../compiler/lib/intel64
prepend-path INCLUDE  $IPPPATH/include
prepend-path NLSPATH $IPPPATH/lib/intel64/locale/%l_%t/%N
setenv IPPROOT $IPPPATH

set TBBPATH  $cmplr_path/tbb
prepend-path LD_LIBRARY_PATH $TBBPATH/lib/intel64/cc4.1.0_libc2.4_kernel2.6.16.21
prepend-path LIBRARY_PATH  $TBBPATH/lib/intel64/cc4.1.0_libc2.4_kernel2.6.16.21
prepend-path CPATH  $TBBPATH/include
setenv TBB30_INSTALL_DIR $TBBPATH

set MKLPATH  $cmplr_path/mkl
prepend-path LD_LIBRARY_PATH $MKLPATH/lib/intel64
prepend-path LIBRARY_PATH  $MKLPATH/lib/intel64
prepend-path CPATH  $MKLPATH/include
prepend-path FPATH  $MKLPATH/include
prepend-path INCLUDE  $MKLPATH/include
prepend-path NLSPATH $MKLPATH/lib/intel64/locale/%l_%t/%N
setenv MKLROOT $MKLPATH

setenv PROD_DIR /home/apps/intel/composerxe-2011
setenv CPRO_PATH /home/apps/intel/composerxe-2011.4.191
setenv INTEL_LICENSE_FILE $cmplr_path/licenses:/home/apps/intel/licenses:/opt/intel/licenses


#MPI???

# set MPIRTPATH  $cmplr_path/MPIRT
# prepend-path LD_LIBRARY_PATH $MPIRTPATH/lib/intel64
# prepend-path PATH $MPIRTPATH/bin/intel64

其中：

#%Module1.0  ！modulefile开头格式，必须有，否则无法识别

conflict modulefile ！与当前的intel compiler modulefile有冲突的modulefile，即如果modulefile已经被加载，那么intel compiler modulefile将不能被加载。

prepend-path 相关环境变量 相关路径 

setenv 环境变量名 值  

5. 常见命令：

module help  显示帮助信息
module avail  查看所有可用的软件环境变量
module load/add  加载对应的环境变量
module list  查看已导入的环境变量
module unload/rm  删除以导入的环境变量
module switch mod/版本时间  改变环境变量的版本号
module swap mod1 mod2  替换环境变量

6. 在TH-1A上调用module模板（例调用phonopy应用包）

• $ module avail ：确定相应的phonopy包在module里面
• $ module list ：没有加载此模块
• $ phonopy ：测试结果为无法正常使用
• $ module load phonopy/2.1.3-py27 ： 加载此模块
• $ phonopy ：测试结果为可正常使用