服务器手动安装并编译R环境库包：PROJ→RGDAL

CRAN-Package rgdal

根据CRAN所述，rgdal库被移除。

方式1：conda-forge安装

conda-forge / packages / r-rgdal

错误：缺乏libnsl.so.1

在加载rgdal库，执行以下命令时：

installed <- installed.packages()
"rgdal" %in% rownames(installed)

报错，遇到的问题是：

library(rgdal) 加载失败，报错提示缺少共享库文件：
libnsl.so.1: cannot open shared object file: No such file or directory

这是一个典型的 系统动态链接库缺失（或路径未配置）问题，但完全可以解决 ✅。

🔍 问题分析

• rgdal.so 动态库在加载时依赖 libnsl.so.1。
• 这是一个 系统级别的网络库（libnsl = “Network Services Library”）。
• 它不属于 R 或 rgdal 包，而是由操作系统提供，通常在 Linux 上由 glibc 系统库安装。

✅ 方法一：查找系统中是否已有此库

在终端中运行：

find /lib /usr/lib /lib64 /usr/lib64 -name "libnsl.so*"

或者用更快的方式：

locate libnsl.so

情况 A：如果找到了 libnsl.so.1，例如路径为：

/usr/lib64/libnsl.so.1

那么你可以创建一个软链接到你的 Conda 环境中：

ln -s /usr/lib64/libnsl.so.1 ~/miniconda3/envs/r_env/lib/libnsl.so.1

确保 R 能找到这个库时可以加载 rgdal。

替补方案：采用libnsl.so.3链接 libnsl.so.1

创建软链接模拟 libnsl.so.1，进入 Conda 的 lib 目录：

cd /home/wanzhou/miniconda3/envs/r_env/lib

ln -s libnsl.so.3 libnsl.so.1

创建一个名为 libnsl.so.1 的链接，指向已有的 libnsl.so.3。

📌 注意事项
这种方式虽然是“绕过法”，在大多数情况下是安全的，特别是 libnsl.so.1 和 .so.3 基本兼容。
如果你要部署到生产环境，建议尽量使用与 rgdal 相匹配的系统动态库（例如：安装真正的 libnsl.so.1，或使用更兼容的 Conda 包构建）。

✅ 方法二：系统中没有安装 libnsl.so.1 → 手动安装

如果你有 sudo 权限（推荐）：

CentOS / RHEL：

sudo yum install libnsl

Ubuntu / Debian：

sudo apt-get install libnsl1

✅ 方法三：使用 Conda 安装 libnsl

如果你 没有 sudo 权限，可以通过 Conda 安装 libnsl：

conda activate r_env

conda install -c conda-forge libnsl

conda list libnsl

这会自动将 libnsl.so.1 安装到你的 Conda 环境中，并由 Conda 管理，无需手动软链接。

🧪 验证是否解决

安装或软链接完成后，在 R 中重新尝试加载：

library(rgdal)

如果不再报 libnsl.so.1 错误，说明问题已解决 ✅

方式2：手动安装

cd /home/wanzhou/Packages/

🧱 步骤一：激活 Conda 环境

source ~/miniconda3/bin/activate r_env

📥 步骤二：下载并编译 PROJ

mkdir -p ~/src && cd ~/src
wget https://download.osgeo.org/proj/proj-9.3.1.tar.gz
tar -xzf proj-9.3.1.tar.gz
cd proj-9.3.1

./configure --prefix=$HOME/local
./configure --prefix=/home/wanzhou/Packages/r_local
make -j$(nproc)
make install

参考