
生物信息
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rzyyyy
这个作者很懒,什么都没留下…
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lifelines+ImportError: DLL load failed: The specified module could not be found.
在成功安装了lifelines包后,输入from lifelines import KaplanMeierFitter报错:DLL load failed: The specified module could not be found.lifelines github中也有如此的问题,作者提示输入:from scipy import stats也有类似的报错,需要从scipy包入手解决。查阅一些blog后,发现需要下载numpy + mkl模块,下载地址为:http://www.lfd.u原创 2020-07-12 20:39:06 · 328 阅读 · 0 评论 -
杂
由于在日常的学习中经常会有一些不知道如何归类的知识,就先存放在这里,再作转移~GSEA分析fold change: 衡量基因表达水平 差异倍数(fold change)原创 2020-05-21 22:05:27 · 257 阅读 · 0 评论 -
WGCNA方法简介
加权基因共表达网络(weighted gene co-expression network analysis)是一种广泛使用的数据挖掘方法,用两两变量间相关系数研究生物网络。大致步骤:1、基因共表达定义两向量间的距离;2、选定β值(幂函数评估连接强度),生成邻接矩阵;3、模块中心分析:拓扑重叠指标、模块特征向量;4、建立共表达网络,判断特定模块的模块间枢纽基因。详细介绍:1、用sij...原创 2019-07-13 23:02:15 · 2057 阅读 · 0 评论 -
PyMol操作
查看文件目录pwd修改文件目录cd + <文件路径>载入PDB文件本地:load <filename>网络:fetch <pdb id>,<object_name> #<object_name>可无鼠标操作键盘左键中键右键无rotate,旋转图像translate,平移zomm,变...原创 2019-10-06 11:28:27 · 3910 阅读 · 1 评论