R语言安装包Seurat

最新推荐文章于 2024-12-07 22:13:28 发布

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#r语言 #开发语言

文章讲述了在Ubuntu22系统中，安装Seurat包时遇到httr和plotly依赖缺失的问题，给出了在终端使用apt和libcurl4-openssl-dev修复依赖并重新安装相关包的步骤。最后，演示了如何在R中加载Seurat库。

环境Ubuntu22，R4.1

also installing the dependencies ‘curl’, ‘openssl’, ‘httr’, ‘plotly’

R包安装的时候报了这个错误ERROR: dependencies 'httr', 'plotly' are not available for package 'Seurat'

请添加图片描述

解决方法，退出R，在terminal中键入：

apt install curl
apt install openssl

apt-get install libcurl4-openssl-dev --fix-missing
apt install libssl-dev

进入R，键入如下：

install.packages("curl")
install.packages("openssl")
install.packages("httr")
install.packages("plotly")
install.packages("Seurat")

解决问题，在R语言中输入，

library(Seurat)

请添加图片描述

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樱木之

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