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RSS订阅转载 安装某些R包时报错ERROR: loading failed for ‘i386‘
安装某些R包时报错ERROR: loading failed for 'i386'
2022-12-09 17:02:24
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转载 WSL安装软件报错/sbin/ldconfig.real: /usr/lib/wsl/lib/libcuda.so.1 is not a symbolic link
/sbin/ldconfig.real: /usr/lib/wsl/lib/libcuda.so.1 is not a symbolic link 作者：等待是一种选择 https://www.bilibili.com/read/cv16415980/ 出处：bilibili
2022-07-13 18:05:37
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原创 R中文路径乱码问题
换了台新电脑后出现了这种问题，就是有些文件的文件名是中文的，或者我想保存为中文名时都会报错，而且中文都会时乱码的，将Rstudio的编码方式设置为utf-8也没作用，最后在网上发现可以在控制台输入Sys.setlocale("LC_ALL","Chinese")后完美的解决了问题...
2021-03-24 09:37:35
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原创 PS在导出图片时提示无法加载扩展，未经正确签署
原因破解版的软件没有在电脑里面注册，被认为是非法程序解决办法：手动注册win10 win+R打开运行，输入regedit打开注册表按照HKEY_CURRENT_USER/Softerware/Adobe/CSXS.9,双击打开CSXS.9文件夹，根据版本不同，可能为CSXS.6/7/8等在空白处右键新建，字符串值新建成功后将【新值 #1】重命名为【PlayerDebugMode】,（如果发现已经有同样的注册表，可以找一下CSXS6/7/8这些文件夹新建），然后双击设置数值为【1】，最后确定
2021-03-10 11:12:11
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原创 R安装本地包的方法
在代码中直接使用 R中使用： install.packages(“libs/xxxx.tgz”,repo=NULL,type=”source”)或者在直接使用R CMD INSTALL 包路径
2020-12-17 15:20:09
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转载 windows10 java JDK配置
转载自https://www.runoob.com/w3cnote/windows10-java-setup.html
2020-12-16 20:38:04
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原创 R 修改安装包默认存放位置的方法
目录R语言修改安装包的默认储存位置查看默认的安装包位置第一种方法会修改当前用户的R包位置第二种方法 永久改变 永久有效第三种方法 修改环境变量总结R语言修改安装包的默认储存位置查看默认的安装包位置一般会有两个目录，如下，第一个目录是当前用户的目录，当前用户有写入权限；第二个为系统级别的目录，对所有用户适用.libPaths()[1] “C:/Users/HuEn/Documents/R/win-library/3.6”[2] “C:/Program Files/R/R-3.6.3/librar
2020-12-16 20:31:26
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原创 win10 mingw64安装配置
推荐使用本地安装的模式sourceforge下载地址:x86_64-8.1.0-release-posix-seh-rt_v6-rev0推荐使用IDMdownload下载，速度杠杠的，没有的可以找我要。解压到要安装的目录，我是直接放到了c盘配置环境变量测试...
2020-12-16 17:08:16
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原创 jetbrains-clion c++的配置
visual studio code 配置太麻烦了，visual studio太占空间，对于入门的我来说没必要，还是比较喜欢jetbrains的产品，记录一下安装过程，果然简单了好多好多安装clion下载地址：https://www.jetbrains.com/clion/下载mingw-w64这个文件主要是提供c、g++、c++编译环境下载地址：https://sourceforge.net/projects/mingw-w64/files/注意：直接下载x86——64-posix-s
2020-12-05 15:38:14
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转载 jupyter更改工作目录
转载自：https://blog.youkuaiyun.com/weixin_35757704/article/details/90051869按照网上流传的三种修改方式一步一步做下来，都没有成功。反复试验了几次终于成功了。后来推测大概是安装过程和系统环境不同导致的。我的环境：我用的系统是 Win 10，Anaconda 是从官网直接下载 .exe 文件安装的。所有设置都是默认设置。 Jupyter Notebook 是 Anaconda 默认安装的，没有另行处理。安装完成后，开始菜单中的目录如下：此时的 Ju
2020-12-05 15:16:31
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原创 使用python实现一个简单的决策树
文章目录写在前面ID3算法的决策树的实现--python几个基础的概念用python实现一个实例写在前面刚开始学习机器学习，深度学习这一块，觉得有必要动手写一下，当然python里面已经有很成熟的包可以做到这些事情，我主要是了解其中的原理，参考了别人的文章https://blog.youkuaiyun.com/csqazwsxedc/article/details/65697652，例子使用也是该文章中的，主要是在写法上有一些自己的改变。附上我的女神：ID3算法的决策树的实现–python几个基础的概念
2020-11-18 22:18:50
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原创 python pyinstaller使用过程中遇到的问题记录
写在前面附上我的女神：之前也有使用过pyinstaller打包脚本，没有遇到什么问题，今天突然一下子遇到了好多问题，觉得有必要记录一下。环境说明我使用的windows64的平台，python版本为3.7.2，是使用ananconda进行安装的,需要打包的脚本是使用jupyter写的，很简单的一个用来统计结果的脚本，就用到了pandas和openpyxl两个库我的脚本这个脚本是用来统计当前目录下xlsx文件中两个比较简单的数据，因为实验需求，每次打完质谱使用PD后都要做这么一个简单的统计，如果样
2020-11-18 21:51:45
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原创 决策树第一次学习：ID3算法的python实现
文章目录ID3算法的决策树的实现--python几个基础的概念用python实现一个实例ID3算法的决策树的实现–python几个基础的概念信息熵或者熵在信息论与概率统计中，熵（entropy）是表示随机变量不确定性的度量。设X是一个有限的离散随机变量，其概率分布为P(X=xi)=pi,i=1,2,...,nP(X=x_i)=p_i,i=1,2,...,nP(X=xi)=pi,i=1,2,...,n则随机变量X的熵定义H(X)= −∑i=1n(PilogPi)-\sum_{i=1}^{
2020-11-13 21:56:46
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原创 linux R3.6安装survminer报错
记录一下今天在linux上安装R包survminer报错报错信息为：R package foreign is not available for maptoolsremove maptools from …由此导致其他几个包安装失败，进而导致survminer安装失败1.查看是否安装了 foreign包：.packages(all.available=T)发现并没有安装该包2：在线安装：install.packages(“foreign”),报错 R package foreign is n
2020-10-24 16:15:16
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转载 非root安装R以及依赖环境
转载：https://www.omicsclass.com/article/166R当中有很多包，这些包之间有很多依赖关系，如果不是最新版本的R，在安装R各种包的时候，就会默认安装一些低版本的包。有些包更新频繁，例如：clusterprofile，如果你的R版本太低就只能安装低版本的，或者有些包根本安装不上去，所以必须更新一下自己linux 上的R版本了，这里我源码安装了一下R最新版本，分享一下。一、安装依赖库：可参照这个地方：http://pj.freefaculty.org/blog/?p=315
2020-10-24 10:04:36
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原创 cut命令
使用说明:cut 命令从文件的每一行剪切字节、字符和字段并将这些字节、字符和字段写至标准输出。如果不指定 File 参数，cut 命令将读取标准输入。必须指定 -b、-c 或 -f 标志之一。参数:-b ：以字节为单位进行分割。这些字节位置将忽略多字节字符边界，除非也指定了 -n 标志。-c ：以字符为单位进行分割。-d ：自定义分隔符，默认为制表符。-f ：与-d一起使用，指定显示哪个区域。-n ：取消分割多字节字符。仅和 -b 标志一起使用。如果字符的最后一个字节落在由 -b 标志的 L
2020-10-23 10:47:35
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原创 关于在linux上使用R安装stringi包时其依赖库icudt61l.zip无法自动下载的问题
这个问题是我在服务器上安装NMF包时发现由于该库无法下载完成导致stringi包安装失败，进一步导致NMF安装失败1.首先在winodows上使用下载工具手动下载stingi和icudt61l.zip这两个包，下载完之后上传到服务器2.R CMD INSTALL --configure-vars='ICUDT_DIR=/home/test/software/R_library' stringi_1.3.1.tar.gz#注意/home/baoadmin/software/R_library 是指icu
2020-09-23 14:11:36
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原创 ubuntu下使用conda安装R3.6版本后安装survminer
1.由于没有root权限，所以使用miniconda2来按住哪个R为什么没有使用最新版本的miniconda3，是因为在安装miniconda3之后总是报错conda.sh中语法错误，考虑到可能是因为和系统不兼容?重新安装miniconda2之后不再有此错误了miniconda的下载可以到清华的镜像源中去下载：https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/在下载的时候需要首先知道自己的系统是多少位的系统使用 getconf LONG
2020-09-23 14:04:45
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原创 使用annovar注释突变数据
1.annovar下载安装https://doc-openbio.readthedocs.io/projects/annovar/en/latest/annovar官方网站的的下载需要使用邮箱注册后才可下载，这里为了使用方便我将刚下载的annovar上传到了网盘链接：https://pan.baidu.com/s/1T0PhTP1TMADsoFApTUPUOw提取码：uw7f...
2020-09-15 17:50:13
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原创 linux中用shell将子字符串切割为数组
a="a,ba,c,f,c,ds,f,d"OLD_IFS=$IFS #IFS是shell环境变量中一个特殊的字符，用来储存内部分割符号，首先将shell的默认分割符进行保存IFS=,#设置内部分割符号为，for i in $a doecho $idoneIFS=OLD_IFSfor i in $a doecho $idoneabacfcdsfda, ba ,c ,f ,c ,ds ,f ,da="a,ba,c,f,c,ds,f,d
2020-09-14 21:55:36
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原创 如何在jupyter中使用R
刚冲浪的时候发现在jupyter中使用R好像也很不错的样子，于是操作一番。前提是已经在电脑上有安装anaconda31.最简单的方法直接在Anaconda prompt中运行：conda install -c r r-essentials但是这种方法存在一个问题就是会重新下载安装一个R,这样会比较占空间所以就直接放弃了2.安装IRkernel1.首先打开Anaconda prompt，在anaconda环境下进行以下操作，注意不能在Rstudio环境中进行：2：在确保R安装路径已经在系统环境变
2020-09-09 22:17:29
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原创 记录几个比较常用的python复制文件的方法
python复制文件的方式有很多个，针对不同的目的有不同的操作，可以对文件权限，描述信息进行复制或者不复制操作，这里只记录了几个我日常会用到的from shutil import copyfile,copy,copyfileobjimport oshelp(copy)# Help on function copy in module shutil:# copy(src, dst, *, follow_symlinks=True)# Copy data and mode bits ("c
2020-09-09 21:40:20
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原创 使用awk将gencode gtf注释文件转换为bed格式
gencode注释文件下载1.gencode注释文件下载地址：https://www.gencodegenes.org/human/release_35lift37.html安装gawk安装gawk主要是为了调用gensub功能，有关gensub功能解释见：http://blog.sina.com.cn/s/blog_6e5e78bf0100waml.htmlsudo apt-get install gawk格式转换#首先看一下gtf文件，我们所需要的是基因的位置注释性息，也就是第三列为ge
2020-09-07 15:19:54
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原创 python selenium xpath-helper chromedriver的安装
1.安装selenium我是在windows端使用的anaconda中的spyder，直接打开anaconda prompt(类似windos的cmd)pip install prompt2.下载chromedriver插件1：下载地址：(https://npm.taobao.org/mirrors/chromedriver/)注意要下载自己浏览器对应版本的插件，谷歌浏览器的版本可以通过点解浏览器右上角的箭头进入帮助中查看2：下载解压后将插件放入系统环境变量目录中，或者将目录加入到系统环境变
2020-09-04 09:49:41
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原创 在ubuntu18.04上安装拷贝数变异检测工具TitanCNA踩坑记录
一、写在前面1：在自己电脑上安装ubuntu系统遇到的坑就不说了(引导问题，显卡不兼容问题，检测不到显卡，触摸板无法使用，两个shift健只有一个能用，伴随的就是一次次的卡死和强制重启…心疼我的硬盘)。2：之前有在实验室服务器上尝试安装过TitanCNA，但是这个R package因为各种包的依赖问题而需要root权限去处理。。。。。3：写博文的目的纯粹是做记录用，作为一个十足的菜鸟，还没资格交流二、R版本转换TitanCNA(http://www.bioconductor.org/package
2020-07-31 23:41:57
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空空如也
r parallel::makeCluster 在进行并行时无限期挂起
2021-04-22
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