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小七毛
这个作者很懒，什么都没留下…
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如何安装SRAdb？
source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("SRAdb")ps：如果安装失败，提示版本不正确的话，记得更新为它需要的版本library(SRAdb)srafile = getSRAdbFile()con = dbConnect('SQLite',srafile)Now we are ready to query the local...原创 2018-06-29 21:59:08 · 855 阅读 · 0 评论 -
R中的GEOmetadb包，查询NCBI数据
Retrieve the information (ex: A specific tissue RNA-Seq) that related to specific SRA number：Can use GEOmetadb to access NCBI GEO information in a similar way as for SRA data and SRAdb.官网GEOmetadb包使用代...原创 2018-06-30 14:15:55 · 1052 阅读 · 0 评论 -
SRA-toolkit中prefetch获取数据保存地址如何改变？
参考官网：https://trace.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/sra/sra.cgi?view=toolkit_doc&f=std 需要注意的是：要建立一个空的文件夹，不然会提示你所指定的目录非空，从而改变不成功。...原创 2018-07-02 10:28:12 · 4399 阅读 · 0 评论