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原创 CNV拷贝数变异cnvkit

taozyblog.com.cn/post/2024-01-03_cnvkit_usage/

2025-01-21 15:48:17 111

原创 批量截取IGV图片

再打开IGV-Tools-Run Batch Script运行txt文件。用python写igv命令。输入的excel表格式为。

2024-08-29 18:04:06 293

原创 GATK BQSR-碱基质量矫正

QualityScore(质量分数)代表的是测序仪器在初始测序时为每个碱基分配的质量分数。EmpiricalQuality(经验质量)代表的是通过分析实际测序数据计算得出的质量分数。这些经验质量分数是基于观察到的错误率(例如错配、插入和删除)来调整原始的质量分数,从而更准确地反映测序数据的真实质量。然而,机器产生的分数会受到各种系统性(非随机)技术误差的影响,导致数据中的碱基质量分数被高估或低估。这些误差有些是由于测序反应的物理或化学原理造成的,有些可能是由于设备的制造缺陷造成的。什么是碱基质量矫正?

2024-08-28 14:04:30 659

原创 miniconda报错CondaHTTPError

conda不能更新,CondaHTTPError: HTTP 000 CONNECTION FAILED for url

2024-08-06 14:47:13 291

翻译 fgbio分析UMI

【代码】fgbio分析UMI。

2023-04-06 21:36:27 814 1

原创 MIPGEN分析smMIP

65535是ucs2 1114111是ucs4。下载python压缩包安装python。

2023-04-06 21:34:27 156 1

原创 建立软连接命令

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2023-03-31 22:32:11 553 1

原创 Hive实验2

1.正确建表,导入数据(三张表,三份数据),并验证是否正确create table course(cid int ,cname string) row format delimited fields terminated by ‘,’;load data local inpath ‘/home/hadoop/file/hive/course.csv’ into table course;se...

2019-11-18 21:49:58 3404

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