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提示：文章写完后，目录可以自动生成，如何生成可参考右边的帮助文档文章目录约束文件一、概述二、Constraint Types1. Single constraintsAtomPair：三、Function Types四、Code for Reading Constraints约束文件一、概述Rosetta约束是对scorefunction的补充。(这相当于其他程序中的“约束”。)它们被用来对结构的几何和其他特征进行评分，而这些特征可能无法用标准评分术语来评估。例如，添加一个基于实验知识的评分偏差

提示：文章写完后，目录可以自动生成，如何生成可参考右边的帮助文档文章目录Rosetta中重要概念的介绍1. Rosetta philosophy2. Pose3.Conformation4. ResidueChemical Layer5. ResidueType6. AtomTypeKinematic Layer7. FoldTreeThe fold treeJump edges vs "peptide" edgesCutpointsFoldTree output8. AtomTree9. Ener

提示：文章写完后，目录可以自动生成，如何生成可参考右边的帮助文档文章目录前言一、教程1. Minimizer1.介绍2.目标3. How-To: Minimize分析输入结构设置flags文件运行minimization命令分析输出4. How-To: Minimization with Constraints设置flags文件和约束文件运行minimization命令分析输出5. How-To: Minimization with a MoveMapThe MoveMap关于FoldTree的说明mo