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翻译 分析hhr文件
文章目录一、使用步骤1.Summary hit list分析hhr文件一、使用步骤1.Summary hit list列表按 ‘Prob’ 排列。No:模板索引Hit:模板名称Prob:模板是一个true positive的概率。对于一个true positive,考虑了ss列的二级结构得分,以及Score列的原始得分。true positives被定义为...
2021-12-14 20:04:13
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原创 显示array全部内容
1.显示array全部内容import numpy as npnp.set_printoptions(threshold=np.inf)2.显示张量全部内容首先将张量转换为array.numpy()PS:array转换为张量:torch.from_numpy()
2021-12-01 22:31:33
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翻译 Rosetta中文教程(三)
提示:文章写完后,目录可以自动生成,如何生成可参考右边的帮助文档文章目录约束文件一、概述二、Constraint Types1. Single constraintsAtomPair:三、Function Types四、Code for Reading Constraints约束文件一、概述Rosetta约束是对scorefunction的补充。(这相当于其他程序中的“约束”。)它们被用来对结构的几何和其他特征进行评分,而这些特征可能无法用标准评分术语来评估。例如,添加一个基于实验知识的评分偏差
2021-11-03 10:58:48
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翻译 Rosetta中文教程(二)
提示:文章写完后,目录可以自动生成,如何生成可参考右边的帮助文档文章目录Rosetta中重要概念的介绍1. Rosetta philosophy2. Pose3.Conformation4. ResidueChemical Layer5. ResidueType6. AtomTypeKinematic Layer7. FoldTreeThe fold treeJump edges vs "peptide" edgesCutpointsFoldTree output8. AtomTree9. Ener
2021-11-03 10:06:58
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翻译 Rosetta中文教程(一)
提示:文章写完后,目录可以自动生成,如何生成可参考右边的帮助文档文章目录前言一、教程1. Minimizer1.介绍2.目标3. How-To: Minimize分析输入结构设置flags文件运行minimization命令分析输出4. How-To: Minimization with Constraints设置flags文件和约束文件运行minimization命令分析输出5. How-To: Minimization with a MoveMapThe MoveMap关于FoldTree的说明mo
2021-11-02 21:38:55
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原创 安装pytorch步骤即遇到错误的解决方法
anaconda安装pytorch步骤即遇到错误的解决方法安装pytorch1.打开2.链接:[pytorch官网](https://pytorch.org/get-started/locally/)输入安装指令(蓝色)安装出现报错【WARNING conda.gateways.disk.delete:unlink_or_rename_to_trash(140): Could not remove or rename D:\anaconda\pkgs\pytorch-1.5.0-py3.7_
2021-07-21 19:52:51
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空空如也
空空如也
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