
生信
文章平均质量分 56
cv一段代码交差
这个作者很懒,什么都没留下…
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生信软件:psiblast、HH-suite3使用anaconda安装
我用的python3.6版本,网络上都是从ftp直接下载psiblast的压缩包,然后解压使用,再配置环境变量,和再anaconda中安装是一样的。原创 2023-07-06 17:41:10 · 1035 阅读 · 2 评论 -
使用awk处理多行fasta文件拆分为单个fasta文件,并去掉后缀^M
大文件:31万个序列(我看的文章里面说一小时处理100条序列,这里我用了)代码如下:把mulfa.fasta文件拆分成单个fasta文件awk '{if($0~/^>/)a=$0; else{system("echo \\"a"\"\n\""$0a)}}' mulfa.fastamulfa.fasta文件如下:生成的单个fasta文件如下:小文件处理及代码解释如这篇文章所说:http://t.csdn.cn/xTZId感谢这位大佬......原创 2022-05-16 10:25:15 · 1708 阅读 · 3 评论