Cytoscape软件使用之STRING的PPI文本文件导入画连通图
最近在用cytoscape软件分析我DGEs的蛋白互作网络图,用到了这个软件中的节点和边的设置,以及网络节点根据各种算法来布局。下面我将按照五个部分来介绍,分别是数据导入,节点设置,边设置,布局展示,图片/文件导出。说明下我的cytoscape是3.7.1的,安装的时候java环境是jdk8一、数据导入 1、我们事先在STRING网站输入已经整理好的差异表达基因,然后会生成一个网络图,同时生成一个.tsv的文件,把这个文件下载下来,用Excel打开,里面就有我们连通的节点,以及其他属...
原创
2021-03-10 22:08:17 ·
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