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TTS56
1. 单细胞数据分析
2. 图像识别
3. 单细胞 + 深度学习
4. 数据可视化
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R语言常用代码
表格查看数据框DT::datatable(df,filter='top')R包的安装rm(list = ls()) options()$repos options()$BioC_mirroroptions(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn/bioc/")options("repos" = c(CRAN="https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/"))options()$repos option原创 2021-06-28 08:47:48 · 5815 阅读 · 1 评论 -
python常用代码汇总
https://zhuanlan.zhihu.com/p/352690273原创 2021-04-23 15:40:21 · 5579 阅读 · 0 评论 -
(单细胞-SingleCell)单细胞标准流程(简化版)
seurat流程# 1.构建对象min.cells = 0 # min.cells 某一个基因至少在多少个基因中表达min.features = 0 # min.features 某个细胞至少表达多少个基因sce = CreateSeuratObject(counts = raw.data,metadata = metadata,min.cells =min.cells,min.features =min.features)sce = AddMetaData(object = sce,metada原创 2021-02-25 00:39:40 · 2728 阅读 · 0 评论 -
python 爬虫
python 爬虫转载于LGH(FJMU)import requestsimport osimport timeimport threadingimport pandas as pdfrom bs4 import BeautifulSoupimport randomheaders = { 'User-Agent': 'Mozilla/5.0 (Windows NT 10.0; Win64; x64) AppleWebKit/537.36 (KHTML, like Gecko) Chr原创 2021-12-26 15:16:17 · 536 阅读 · 0 评论 -
单细胞免疫细胞基因marker
T.cell.marker = c("CD3D",'CD3E','CD2')Fib.cell.marker = c('COL1A1','DCN','C1R')Myeioid.cell.marker = c('LYZ','CD68','TYROBP')B.cell.marker= c('CD79A','MZB1','MS4A1')Endothelial.cell.marker= c('CLDN5','FLT1','RAMP2')Mast.cell.marker= c('CPA3','TPSAB1'.原创 2021-10-30 09:00:06 · 13044 阅读 · 0 评论 -
Markdown常用代码
插入图片注释![]()<center> <img style="border-radius: 0.3125em; box-shadow: 0 2px 4px 0 rgba(34,36,38,.12),0 2px 10px 0 rgba(34,36,38,.08);" src="https://img-blog.csdnimg.cn/ba41600176b24aba9c9058bb6550c760.png?x-oss-process=image/watermark原创 2021-10-14 20:52:36 · 859 阅读 · 0 评论 -
Linux (Ubuntu) 常用代码
强制关闭死机程序xkill 是在桌面用的杀死图形界面的程序。比如当firefox 出现崩溃不能退出时,点鼠标就能杀死firefox 。当xkill运行时出来和个人脑骨的图标,哪个图形程序崩溃一点就OK了。如果您想终止xkill ,就按右键取消。xkill提升程序(进程)优先级renice命令用于重新指定一个或多个行程(Process)的优先序(一个或多个将根据参数而定)。注意:每一个行程(Process)都有一个唯一的(unique)id。修改程序优先级,数值越小,优先级越高sudo r原创 2021-10-07 13:15:07 · 860 阅读 · 0 评论 -
OpenCV图像处理
OpenCV图像处理参考:B站——OpenCV计算机视觉实战原博客地址文章目录OpenCV图像处理声明图像的读取和显示和保存通道的剥离和组合Padding图像融合声明 本文内容仅为笔记,方便自己后续做DL时候进行参考,不会用于其他任何用途 安装opencv-python:pip install opencv-pythonpip install opencv-contrib-python图像的读取和显示和保存import cv2 # opencv读取的格式是BGRimport m原创 2021-06-06 17:13:02 · 325 阅读 · 1 评论