敏感性特异性阳性预测值阴性预测值 Youden‘s index的python代码实现

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已于 2022-11-24 11:31:44 修改 · 989 阅读

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#python #开发语言

于 2022-11-11 11:52:49 首次发布

本文提供了敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值和Youden's Index的Python代码实现，代码简洁易懂，方便直接使用。

def get_sen_spe(SR, GT, threshold=0.8):
    Sen = 0.0
    Sep = 0.0
    SR = SR > threshold
    GT = GT > threshold
    TP = ((SR == 1).byte() + (GT == 1).byte()) == 2
    FP = ((SR == 1).byte() + (GT == 0).byte()) == 2
    TN = ((SR == 0).byte() + (GT == 0).byte()) == 2
    FN = ((SR == 0).byte() + (GT == 1).byte()) == 2
    Sen = float(sum(TP)) / (float(sum(TP + FN)) + 1e-6)
    Sep = float(sum(TN)) / (float(sum(TN + FP)) + 1e-6)
    YD_index = Sen + Sep -1
    PPV = float(sum(TP)) / (float(sum(TP + FP)) + 1e-6)
    NPV = float(sum(TN)) / (float(sum(TN + FN)) + 1e-6)
    return Sen, Sep, PPV, NPV, YD_index