dcm脱敏以及转nii

最新推荐文章于 2025-04-14 11:01:46 发布

qq_40797296

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文章标签： python

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/qq_40797296/article/details/123803882

本文介绍了一种处理DICOM (DCM) 医学影像数据的方法，包括如何使用Python进行脱敏处理以及如何将DCM文件转换为nii格式。通过具体的Python代码示例，展示了批量处理DCM文件的具体步骤。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

文章目录

- - DCM脱敏以及DCM转nii序列
  - - - Dcm脱敏
        Dcm转nii

DCM脱敏以及DCM转nii序列

Dcm脱敏

from glob import glob
import pydicom as dicom
# 单个Dcm文件夹脱敏（Dcm文件夹内包含一个病例的Dcm文件）
path = sorted(glob('file_path/*'')) # file_path为Dcm文件夹路径

for file_path in path:
    
    ds = dicom.dcmread(file_path)
    ds.PatientName = 'Invisible'
    ds.PatientID = 'Invisible'
	ds.InstitutionAddress = 'Invisible'
    ds.InstitutionName = 'Invisible'
    ds.save_as(r'./new_file/{}'.format(file_path.split('/')[-1][-16:]))

Dcm转nii

import SimpltITK as sitk

reader = sitk.ImageSeriesReader()
dcmName = reader.GetGDCMSeriesFileNames('file_path') # file_path为Dcm文件夹路径
reader.SetFileNames(dcmName)
sitkData = reader.Execute()
sitk.WriteImage(sitkData, 'new_file.nii.gz')