- 博客(9)
- 收藏
- 关注
RSS订阅原创 SPM通过直线划分脑区
提取出来的矩阵是个零矩阵，可能是因为提取软件不太对，最后生成的nii文件相关信息缺失。我使用wfu_pickatlas工具包提取出来的nii模板不能进行后续的操作，仍旧使用spm中ImCalc功能提取出壳核。是个比较简单的细分脑区的方法，有条件还是能找更详细的图谱，毕竟这种方法也比较容易出现问题。像壳核这种比较小的结构可能问题不算大，更大一些的结构用这种方法问题就出现各种问题了。目的：在找NII脑区的时候，有些亚区atlas模板提供不了，此处是一种比较简单的划分脑区的方法，即通过横切面划分脑区。
2025-01-07 15:53:32
244
原创 读取nicolet脑电数据的方法
这个方法在eeglab是可行的，但是读入eeglab之后，部分原本的脑电数据的基本信息没有被保存，在后面需要相关被试信息，比如开始扫描的时间、被试的基本信息等等。此处的意思是，读取第一个分段（可以通过前面的segments的信息获得）的1-1000个时间点的前10个通道的采集的数据。则变量OUT则为采集到的脑电信号。由nicolet设备生成的脑电数据，多是.e结尾的脑电数据，之前写过一篇关于读取.e结尾的文件的脑电的方法。使用方法很简单，将下载下来的工具包置于工作路径之后，在命令行窗口直接输入代码即可。
2024-09-25 14:10:48
351
原创 eeglab使用FCLAB插件安装的问题解决
补充：我原来是习惯用添加并包含子文件的方式添加各种toolbox的，但是在添加eeglab的时候，用添加并包含子文件夹的方式，会弹出来一堆窗口，而且只能按否，当前路径只能用于本次运行，下次运行的时候还要再添加eeglab，虽然有些麻烦，但是也算是解决问题了。核对了FCLAB也没有放错位置，查了下出现这个问题基本是文件夹放错位置的原因。所示的方法进行计算的，在实际操作的过程中，EEGLAB出现了下图的错误。在计算EEG的相干性的功能链接的时候，是根据。，然后问题就解决了。
2024-08-16 13:50:24
495
原创 脑电EEGLAB数据预处理去除坏段ICA
写这篇文章是对网上阅读量比较多的的EEGLAB预处理流程的补充（主要还是看这两篇文章了）两篇文章脑电预处理流程基本差不多，但是用的EEGLAB和MATLAB版本都比较旧了，EEGLAB13在官网基本下载不到了，在实际操作中存在一些小差别，而且存在更简便的解决方法。
2024-08-05 13:52:24
881
原创 过大EEG数据过大的处理——EEGLAB导出
下图是一个3000m的数据，一般来说当数据比较大的时候通过降采样的方法来减小数据的大小，但是降采样（resample）之后数据并没有明显减少，采集时间也不是特别长，然后就想可能原因是由于一些参数导致文件爆炸，于是决定将EEG数据导出为EDF/BDF等格式的数据，这种格式的数据算是压缩比较的好的了。之前在处理.e格式的数据的时候，虽然可以把.e格式的数据导入到eeglab但是，处理之后存在数据太大不能保存的问题，可能是我这边数据太大，有的时候数据都有4000m以上了。再导入EDF/BDF格式的数据时。
2024-08-04 14:36:45
533
原创 在docker环境下安装dpabi
以前都是在matlab中运行dpabi，matlab安装起来很麻烦，而且安装包很大，我现在用的版本已经有20g，在换电脑的时候重新安装一遍matlab都要小半天。遗憾的是在今年6月份的时候docker官网墙了，所以我的docker环境配置也是用别人安装包装的。2.docker镜像在官网就可以下，有百度云链接，如果docker可以直接通过pull抓下来，毕竟百度云的速度真的不一般。安装过程很简单，官网写的也很明白，会写这篇是因为不太熟悉很多软件，导致安装过程出现了很多小问题。不再多说废话了，开始安装流程。
2024-07-28 18:26:48
864
原创 .e格式脑电数据的读取
由于收到了一批.e格式的脑电数据，稍微查了下，这些是比较老的.eeg格式数据，有些老设备会导出.e格式，而不能导出.eeg格式。通过fileio选项，然后选取.e文件即可，在读取的过程中出现一些弹框跟eeglab读取其他格式文件一样，空着就是默认，有些弹窗需要命名的可以命名。一般情况下filio这个读取文件的拓展包还需要额外下载，eeglab会提醒，下载即可。读取时间比较长，这边20m左右的数据，读取了大概10分钟左右，感觉效率不是很高。在读取的时候，如果存在报错，关于ft变量的相关报错。
2024-07-18 16:07:35
675
原创 Windows终端输入代码换行
有的时候由于代码太长了，为了代码的整洁，在终端里输入代码需要换行。不怎么使用window终端，在日常使用的时候问题蛮多的。在很多示例代码块里用的是\，但是在实际输入中，使用。需要改进的地方：代码块的复制。
2024-07-12 10:08:17
613
空空如也
空空如也
TA创建的收藏夹 TA关注的收藏夹
TA关注的人