Linux (CentOS) 本地安装graphviz/pygraphviz (无root权限)

graphviz/pygraphviz

graphviz: 图可视化工具。

pygraphviz: Graphviz对应的python包。

需要先安装graphviz才能使用pygraphviz.

官网给的教程都需要root权限，本文提供无root安装graphviz的思路。

安装graphviz.

graphviz source code: https://www.graphviz.org/download/source/ 选一个最新版本下载并解压。

在本地~/新建一个usr/local。 运行./configure的时候加一个prefix。

mkdir ~/usr/local/graphviz
./configure --prefix ~/usr/local/graphviz
make
make install

make的时候可能会报错，找不到Python.h。这里直接include你自己的python lib路径就好。e.g., CPATH=~/anaconda3/envs/your-cond-env-name/include/python3.8 make.

make install之后，graphviz就被安装在~/usr/local/graphviz里了。

如果你需要运行graphviz/bin里的东西，直接讲路径加入PATH环境变量就好。或者搞软连接到你常用的local bin里面。

graphviz/lib需要加入export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$HOME/usr/local/graphviz/lib环境变量里，不然后面pygraphviz找不到对应的lib。可以把这句话加到.bashrc里面，这样机器一启动机会更新LD_LIBRARY_PATH.

安装pygraphviz.

直接运行pip install pygraphviz会报错，因为你没有安装在有root权限时默认的位置。

这时需要下载pygraphviz的源码：https://github.com/pygraphviz/pygraphviz

直接运行python setup.py install也会报错，原因同上。

这时需要在LD_LIBRARY_PATH和CPATH里include你自定义安装的graphviz的lib和include

LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:$HOME/usr/local/graphviz/lib LIBRARY_PATH=$LIBRARY_PATH:$HOME/usr/local/graphviz/lib CPATH=$HOME/usr/local/graphviz/include python setup.py install

测试：

python -c "import pygraphviz as pgv"

没报错就OK。