shell脚本
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学生信的大叔
生信分析工程师
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无 if else的shell脚本下载公共测序数据
shell脚本，不一定要写if else。可以通过运算符||与&&管理命令， 我的理解是通过命令返回状态来决定运行哪个/块命令。我们最常见的例子是。更加复杂的例子是运算符||和&&配合{}或()写。不要觉得没必要，这可能是你工作以后shell脚本常态。今天以利用Aspera从ENA数据库下载测序数据为例进行简单举例。下面给个稍微简单点的一个示例命令。原创 2023-12-17 00:21:13 · 417 阅读 · 0 评论 -
shell脚本 | 批量从GenBank/RefSeq下载NCBI基因组
今天有客户联系要通过GenBank的accession number批量下载基因组，结果回复客户可以批量下载后，客户就没再回复过。。。这个功能之前就想写，只是觉得用的可能不是很多，就没写。既然今天遇到了，恰巧最近着重学shell脚本，就把这个功能封了个shell脚本。用到的shell知识点都还算基础，也是必学的，下面介绍了脚本的特点和功能，感兴趣脚本写法的也可以购买来看看。原创 2023-10-09 20:54:23 · 1044 阅读 · 0 评论