
Linux_Shell
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知无牙
盛年不重来,一日难再晨。及时当勉励,岁月不待人。
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让我们的脚本带点色儿
我们通常在Linux中用echo就是用来打印字符串或者变量的,类似于其他语言中的print()函数。用法如下:(1)echo “Hello World!”# 示例代码:myname="liunxuser; # 创建变量";echo “Hello World!”; echo “$myname“;echo “${myname}“# 双引号会解释$、\和`这三种特殊字符echo 后面可以跟双引号围绕的字符串或者变量(2)echo 'Hello World!'# 单引号将所有字符都看成普通字符原创 2021-06-26 12:39:20 · 311 阅读 · 0 评论 -
实用awk一行流01
废话没有,直接上实用代码,当你着急忙慌的时候,希望它能帮到你测试数据:WorldCupGroup.data(9行X6列)cat WorldCupGroup.data分组第一档第二档第三档第四档第五档A组 中国 叙利亚 菲律宾 马尔代夫 关岛*B组 澳大利亚 约旦 台湾地区 科威特 尼泊尔C组 伊朗 伊拉克 巴林 中国香港 柬埔寨*D组 沙特阿拉伯 乌兹别克斯坦 巴勒斯坦 也门 新加坡E组 卡塔尔 阿曼 印度 阿富汗 孟加拉国*F组 日本 吉尔吉斯斯坦 塔吉克斯坦 缅甸 蒙原创 2021-06-16 13:24:34 · 238 阅读 · 0 评论 -
分享一款生物信息数据高亮工具biosyntax
先上图,见下:喜欢颜色的生信汉子和妹子们,今天分享一款“很有颜色“的生物信息学数据高亮工具给你们,记得三连:收藏,点赞加关注,当然也可以刷火箭,老铁!biosyntax工具的官网在这儿里:https://biosyntax.org/,它可以高亮生物学数据,例如fasta,fastq, gff,gtf, vcf, sam, bed, pdb, cwl等等,支持多种工具:less, vim, gedit, sublime and VScode。提前声明:首先我们要感谢biosyntax的研发团队原创 2021-06-11 23:50:38 · 325 阅读 · 1 评论 -
自己编写Linux-Shell脚本下载序列数据库_2020-11-17
搞生物的、搞生信的离不开下载基因或蛋白序列,如果你有一个物种、一个基因、一个蛋白、一个RNA还好说,我就点点下载呗,但是如果你要下载的物种、基因或蛋白很多很多,是个长列表,那就不适合一个一个的费力的下载了,这个时候就需要用编程的思想解决问题,让机器不知疲倦的帮我们完成机械式的任务!下面是一个现实任务:需要下载31个物种的蛋白质组FASTA序列数据库,我们使用Linux shell编程去解决,这个方法和思路可以延伸和扩展,大家根据自己的实际问题进行修改代码,我的代码如下:#!/usr/bin/bash原创 2020-11-17 16:58:02 · 579 阅读 · 4 评论